معرفی شرکت ها

bfast-0.7.0a-30.fc37.x86_64.rpm

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Blat-like Fast Accurate Search Tool
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Fedora 37
مخزن Fedora Everything x86_64
نام بسته bfast
نام فایل بسته bfast-0.7.0a-30.fc37.x86_64.rpm
نسخه بسته 0.7.0a
انتشار بسته 30.fc37
معماری بسته x86_64
نگهدارنده -
تاریخ ساخت Thu 21 Jul 2022 02
هاست سازنده buildvm-x86-14.iad2.fedoraproject.org
نوع بسته .rpm
آدرس صفحه اصلی https://github.com/nh13/BFAST
مجوز GPLv2 and MIT
حجم دانلود 639K
حجم نصب 1.289M
BFAST facilitates the fast and accurate mapping of short reads to reference sequences. Some advantages of BFAST include: Speed: enables billions of short reads to be mapped quickly. Accuracy: A priori probabilities for mapping reads with defined set of variants. An easy way to measurably tune accuracy at the expense of speed. Specifically, BFAST was designed to facilitate whole-genome resequencing, where mapping billions of short reads with variants is of utmost importance. BFAST supports both Illumina and ABI SOLiD data, as well as any other Next-Generation Sequencing Technology (454, Helicos), with particular emphasis on sensitivity towards errors, SNPs and especially indels. Other algorithms take short-cuts by ignoring errors, certain types of variants (indels), and even require further alignment, all to be the "fastest" (but still not complete). BFAST is able to be tuned to find variants regardless of the error-rate, polymorphism rate, or other factors.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
bfast-0.7.0a-30.fc37.aarch64.rpm 0.7.0a aarch64 Fedora Everything
bfast-0.7.0a-30.fc37.src.rpm 0.7.0a i686 Fedora Everything
bfast-debuginfo-0.7.0a-30.fc37.aarch64.rpm 0.7.0a aarch64 Fedora Everything
bfast-debuginfo-0.7.0a-30.fc37.x86_64.rpm 0.7.0a x86_64 Fedora Everything
bfast-debugsource-0.7.0a-30.fc37.aarch64.rpm 0.7.0a aarch64 Fedora Everything
bfast-debugsource-0.7.0a-30.fc37.x86_64.rpm 0.7.0a x86_64 Fedora Everything


نیازمندی

مقدار نام
- /usr/bin/perl
- libbz2.so.1()(64bit)
- libc.so.6()(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.14)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.3)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.3.4)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.34)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.4)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.7)(64bit)
- libm.so.6()(64bit)
- libm.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)
- libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)
- libz.so.1()(64bit)
- perl(Cwd)
- perl(Data::Dumper)
- perl(File::Path)
- perl(Getopt::Long)
- perl(Getopt::Std)
- perl(Pod::Usage)
- perl(XML::Simple)
- perl(constant)
- perl(strict)
- perl(warnings)
- rtld(GNU_HASH)


ارائه دهنده

مقدار نام
= 0.7.0a-30.fc37 bfast
= 0.7.0a-30.fc37 bfast(x86-64)


نحوه نصب


نصب پکیج rpm bfast:

    dnf install bfast-0.7.0a-30.fc37.x86_64.rpm


فایل ها

مسیرها
/usr/bin/balignmentscoredistribution
/usr/bin/balignsim
/usr/bin/bevalsim
/usr/bin/bfast
/usr/bin/bfast.resubmit.pl
/usr/bin/bfast.submit.pl
/usr/bin/bgeneratereads
/usr/bin/bindexdist
/usr/bin/bindexhist
/usr/bin/bmfmerge
/usr/bin/brepeat
/usr/bin/btestindexes
/usr/bin/ill2fastq.pl
/usr/bin/solid2fastq
/usr/lib/.build-id
/usr/lib/.build-id/02
/usr/lib/.build-id/02/fa79bb3db1c5df19da9eb0bb4a50dd35cb1fa7
/usr/lib/.build-id/0f
/usr/lib/.build-id/0f/fea65b442cffbd65e4e9b1ebcc0ed30044c08d
/usr/lib/.build-id/6d
/usr/lib/.build-id/6d/b430f43c4cd800ef5d3f9f50049fdc217576f1
/usr/lib/.build-id/81
/usr/lib/.build-id/81/e12b0ea4ec20fbf33c4aecc21d82904f870c7f
/usr/lib/.build-id/86
/usr/lib/.build-id/86/e90c46117eb17f1757294c314788c7d8b64f72
/usr/lib/.build-id/94
/usr/lib/.build-id/94/21115f49779175bb365c62c6bf0f01ccd22210
/usr/lib/.build-id/9e
/usr/lib/.build-id/9e/c882761b8690ec5014e1ed999103c66caadcbc
/usr/lib/.build-id/d7
/usr/lib/.build-id/d7/30c44140d82fff06063f40e4980498a1541311
/usr/lib/.build-id/d7/dcc4328c2e3d666ba7c74eabaea162347be957
/usr/lib/.build-id/e5
/usr/lib/.build-id/e5/999c24f170671931caca42221f04f9e4cf7482
/usr/lib/.build-id/f2
/usr/lib/.build-id/f2/64cbc50c87660f1aa761632c034b682e2d4e83
/usr/share/doc/bfast
/usr/share/doc/bfast/AUTHORS
/usr/share/doc/bfast/ChangeLog
/usr/share/doc/bfast/NEWS
/usr/share/doc/bfast/README
/usr/share/doc/bfast/bfast-book.pdf
/usr/share/licenses/bfast


گزارش تغییرات

تاریخ آخرین تغییر جزئیات
2022-07-20

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_37_Mass_Rebuild

2022-01-19

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_36_Mass_Rebuild

2021-07-21

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_35_Mass_Rebuild

2021-01-26

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_34_Mass_Rebuild

2021-01-01

Fix FTBFS rhbz#1863246

2020-08-01

Second attempt - Rebuilt for

2020-07-27

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_33_Mass_Rebuild