معرفی شرکت ها

fastx_toolkit-0.0.14-30.fc37.aarch64.rpm

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Tools to process short-reads FASTA/FASTQ files
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Fedora 37
مخزن Fedora Everything aarch64
نام بسته fastx_toolkit
نام فایل بسته fastx_toolkit-0.0.14-30.fc37.aarch64.rpm
نسخه بسته 0.0.14
انتشار بسته 30.fc37
معماری بسته aarch64
نگهدارنده -
تاریخ ساخت Thu 21 Jul 2022 07
هاست سازنده buildhw-a64-24.iad2.fedoraproject.org
نوع بسته .rpm
آدرس صفحه اصلی http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/index.html
مجوز AGPLv3+
حجم دانلود 119K
حجم نصب 1.075M
The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for Short-Reads FASTA/FASTQ files preprocessing. Next-Generation sequencing machines usually produce FASTA or FASTQ files, containing multiple short-reads sequences (possibly with quality information). The main processing of such FASTA/FASTQ files is mapping (aka aligning) the sequences to reference genomes or other databases using specialized programs. Example of such mapping programs are: Blat, SHRiMP, LastZ, MAQ and many many others. However, It is sometimes more productive to preprocess the FASTA/FASTQ files before mapping the sequences to the genome - manipulating the sequences to produce better mapping results. The FASTX-Toolkit tools perform some of these preprocessing tasks.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
fastx_toolkit-0.0.14-30.fc37.src.rpm 0.0.14 i686 Fedora Everything
fastx_toolkit-0.0.14-30.fc37.x86_64.rpm 0.0.14 x86_64 Fedora Everything
fastx_toolkit-debuginfo-0.0.14-30.fc37.aarch64.rpm 0.0.14 aarch64 Fedora Everything
fastx_toolkit-debuginfo-0.0.14-30.fc37.x86_64.rpm 0.0.14 x86_64 Fedora Everything
fastx_toolkit-debugsource-0.0.14-30.fc37.aarch64.rpm 0.0.14 aarch64 Fedora Everything
fastx_toolkit-debugsource-0.0.14-30.fc37.x86_64.rpm 0.0.14 x86_64 Fedora Everything
fastx_toolkit-galaxy-0.0.14-30.fc37.aarch64.rpm 0.0.14 aarch64 Fedora Everything
fastx_toolkit-galaxy-0.0.14-30.fc37.x86_64.rpm 0.0.14 x86_64 Fedora Everything


نیازمندی

مقدار نام
- /usr/bin/bash
- /usr/bin/perl
- ld-linux-aarch64.so.1()(64bit)
- ld-linux-aarch64.so.1(GLIBC_2.17)(64bit)
- libc.so.6()(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.17)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.34)(64bit)
- libgcc_s.so.1()(64bit)
- libgcc_s.so.1(GCC_3.0)(64bit)
- libgcc_s.so.1(GCC_3.3.1)(64bit)
- libgtextutils-0.7.so.0()(64bit)
- libstdc++.so.6()(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3)(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.5)(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.9)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.11)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.15)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.18)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.20)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.21)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.29)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.30)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.9)(64bit)
- perl(Carp)
- perl(Data::Dumper)
- perl(GD::Graph::bars)
- perl(Getopt::Long)
- perl(IO::Handle)
- perl(PerlIO::gzip)
- perl(strict)
- perl(warnings)
- perl-GDGraph
- perl-PerlIO-gzip
- rtld(GNU_HASH)
- sed


ارائه دهنده

مقدار نام
= 0.0.14-30.fc37 fastx_toolkit
= 0.0.14-30.fc37 fastx_toolkit(aarch-64)


نحوه نصب


نصب پکیج rpm fastx_toolkit:

    dnf install fastx_toolkit-0.0.14-30.fc37.aarch64.rpm


فایل ها

مسیرها
/usr/bin/fasta_clipping_histogram.pl
/usr/bin/fasta_formatter
/usr/bin/fasta_nucleotide_changer
/usr/bin/fastq_masker
/usr/bin/fastq_quality_boxplot_graph.sh
/usr/bin/fastq_quality_converter
/usr/bin/fastq_quality_filter
/usr/bin/fastq_quality_trimmer
/usr/bin/fastq_to_fasta
/usr/bin/fastx_artifacts_filter
/usr/bin/fastx_barcode_splitter.pl
/usr/bin/fastx_clipper
/usr/bin/fastx_collapser
/usr/bin/fastx_nucleotide_distribution_graph.sh
/usr/bin/fastx_nucleotide_distribution_line_graph.sh
/usr/bin/fastx_quality_stats
/usr/bin/fastx_renamer
/usr/bin/fastx_reverse_complement
/usr/bin/fastx_trimmer
/usr/bin/fastx_uncollapser
/usr/lib/.build-id
/usr/lib/.build-id/22
/usr/lib/.build-id/22/d371ceef8fc105f564038e1b562e3d06f8e6f3
/usr/lib/.build-id/31
/usr/lib/.build-id/31/3f857ee03e0f5222dbe0a66d046bf17ded6588
/usr/lib/.build-id/64
/usr/lib/.build-id/64/90a1c86dde29345ec6c310affcc9367baf9a6c
/usr/lib/.build-id/65
/usr/lib/.build-id/65/b08cc3b1d16777a297752050db8fa087035f4a
/usr/lib/.build-id/66
/usr/lib/.build-id/66/3c98211d987ae68358ee82298de2dee3beb93e
/usr/lib/.build-id/78
/usr/lib/.build-id/78/424f4dd1e3a812ccead1165e1aa9c07eeeb86b
/usr/lib/.build-id/95
/usr/lib/.build-id/95/3da690086746b0e64b05cf3ed512d6288ffb1a
/usr/lib/.build-id/95/f545a59b63bb3d0f8a8ad789b2b22fb9932fee
/usr/lib/.build-id/98
/usr/lib/.build-id/98/adfe362111b1db6119c83253669198c8398254
/usr/lib/.build-id/9c
/usr/lib/.build-id/9c/bb0426086001d709b980df4570a04eb46e3136
/usr/lib/.build-id/bb
/usr/lib/.build-id/bb/33e33723f6b9c057be374b30812058cae09dc6
/usr/lib/.build-id/c9
/usr/lib/.build-id/c9/7a846d083c4c1704dfa6feff4731073c790286
/usr/lib/.build-id/e4
/usr/lib/.build-id/e4/e6e06e1039d45778c28e682036628bf909263c
/usr/lib/.build-id/e8
/usr/lib/.build-id/e8/61277e0b8d60addf2f707f5dc58a42833715c5
/usr/lib/.build-id/ec
/usr/lib/.build-id/ec/6dfe1190a2ef8471b07ceffbd55ec3a1c7c1a1
/usr/share/doc/fastx_toolkit
/usr/share/doc/fastx_toolkit/AUTHORS
/usr/share/doc/fastx_toolkit/COPYING
/usr/share/doc/fastx_toolkit/NEWS
/usr/share/doc/fastx_toolkit/README


گزارش تغییرات

تاریخ آخرین تغییر جزئیات
2022-07-21

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_37_Mass_Rebuild

2022-01-20

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_36_Mass_Rebuild

2021-07-21

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_35_Mass_Rebuild

2021-01-26

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_34_Mass_Rebuild

2020-08-26

No longer force C++11 mode

2020-07-27

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_33_Mass_Rebuild