معرفی شرکت ها


trnascan-se_2.0.0-3_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

detection of transfer RNA genes in genomic sequence
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian non-free amd64
نام بسته trnascan-se
نام فایل بسته trnascan-se_2.0.0-3_amd64.deb
نسخه بسته 2.0.0
انتشار بسته 3
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE
مجوز -
حجم دانلود 150154
حجم نصب 706
tRNAscan-SE identifies 99-100% of transfer RNA genes in DNA sequence while giving less than one false positive per 15 gigabases. Two previously described tRNA detection programs are used as fast, first-pass prefilters to identify candidate tRNAs, which are then analyzed by a highly selective tRNA covariance model. This work represents a practical application of RNA covariance models, which are general, probabilistic secondary structure profiles based on stochastic context-free grammars. tRNAscan-SE searches at ~ 30 000 bp/s. Additional extensions to tRNAscan-SE detect unusual tRNA homologues such as selenocysteine tRNAs, tRNA-derived repetitive elements and tRNA pseudogenes.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
trnascan-se-common_2.0.0-3_all.deb 2.0.0 all Debian non-free


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6
- perl:any
= 2.0.0-3 trnascan-se-common
- infernal


نحوه نصب


نصب پکیج deb trnascan-se:

    sudo apt-get install trnascan-se_2.0.0-3_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./etc/tRNAscan-SE.conf
./usr/bin/EukHighConfidenceFilter
./usr/bin/covels-SE
./usr/bin/coves-SE
./usr/bin/eufindtRNA
./usr/bin/fasta2gsi
./usr/bin/sstofa
./usr/bin/tRNAscan-SE
./usr/bin/trnascan-1.4
./usr/share/doc/trnascan-se/README.gz
./usr/share/doc/trnascan-se/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/trnascan-se/copyright
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example1-tRNAs.bed
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example1-tRNAs.iso
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example1-tRNAs.out
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example1-tRNAs.ss
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example1-tRNAs.stats
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example1.fa
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example2-tRNAs.iso
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example2-tRNAs.out
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example2-tRNAs.ss
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example2-tRNAs.stats
./usr/share/doc/trnascan-se/examples/Example2.fa
./usr/share/man/man1/covels-SE.1.gz
./usr/share/man/man1/covels.1.gz
./usr/share/man/man1/coves-SE.1.gz
./usr/share/man/man1/coves.1.gz
./usr/share/man/man1/eufindtRNA.1.gz
./usr/share/man/man1/trnascan-1.4.1.gz