معرفی شرکت ها
mira-assembler_4.9.6-4+b1_armhf.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Whole Genome Shotgun and EST Sequence Assembler
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main armhf |
| نام بسته | mira-assembler |
| نام فایل بسته | mira-assembler_4.9.6-4+b1_armhf.deb |
| نسخه بسته | 4.9.6 |
| انتشار بسته | 4+b1 |
| معماری بسته | armhf |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://chevreux.org/projects_mira.html |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1874584 |
| حجم نصب | 4568 |
The mira genome fragment assembler is a specialised assembler for
sequencing projects classified as 'hard' due to high number of similar
repeats. For expressed sequence tags (ESTs) transcripts, miraEST is
specialised on reconstructing pristine mRNA transcripts while
detecting and classifying single nucleotide polymorphisms (SNP)
occurring in different variations thereof.
.
The assembler is routinely used for such various tasks as mutation
detection in different cell types, similarity analysis of transcripts
between organisms, and pristine assembly of sequences from various
sources for oligo design in clinical microarray experiments.
.
The package provides the following executables:
Binaries provided:
* mira: for assembly of genome sequences
* miramem: estimating memory needed to assemble projects.
* mirabait: a "grep" like tool to select reads with kmers up to 256 bases.
* miraconvert: is a tool to convert, extract and sometimes recalculate all
kinds of data related to sequence assembly files.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_amd64.deb | 4.9.6 | amd64 | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_arm64.deb | 4.9.6 | arm64 | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_armel.deb | 4.9.6 | armel | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_i386.deb | 4.9.6 | i386 | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_mips.deb | 4.9.6 | mips | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_mips64el.deb | 4.9.6 | mips64el | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_mipsel.deb | 4.9.6 | mipsel | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_ppc64el.deb | 4.9.6 | ppc64el | Debian main |
| mira-assembler_4.9.6-4+b1_s390x.deb | 4.9.6 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | libboost-filesystem1.67.0 |
| - | libboost-iostreams1.67.0 |
| >= 1.67.0-10 | libboost-regex1.67.0 |
| - | libboost-system1.67.0 |
| - | libboost-thread1.67.0 |
| - | libbz2-1.0 |
| >= 2.27 | libc6 |
| >= 2.0.1 | libexpat1 |
| >= 1:3.5 | libgcc1 |
| >= 4.9 | libgomp1 |
| >= 5.2 | libstdc++6 |
| >= 1:1.2.6 | zlib1g |
نحوه نصب
نصب پکیج deb mira-assembler:
sudo apt-get install mira-assembler_4.9.6-4+b1_armhf.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/mira |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/HELP_WANTED |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/NEWS.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/README |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/README.test |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/THANKS |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/changelog.Debian.armhf.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/copyright |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/est_assembly.conf |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/solexa1.conf |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/solexa2.conf |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/fasta_estset1/tvc_mini.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/fasta_estset1/tvc_mini.fasta.qual.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_backbone_in.gbf.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_in.solexa.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_in.solexa.fasta.qual.gz |
| ./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_straindata_in.txt.gz |
| ./usr/share/lintian/overrides/mira-assembler |
| ./usr/share/man/man1/mira.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/mirabait.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/miraconvert.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/miradiff.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/miramem.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/miramer.1.gz |
| ./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/GTAGDB |
| ./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/README |
| ./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/consedrc.13.0 |
| ./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/consedtaglib.txt |
| ./usr/bin/mirabait -> mira |
| ./usr/bin/miraconvert -> mira |
| ./usr/bin/miramem -> mira |
| ./usr/bin/miramer -> mira |