معرفی شرکت ها
fastx-toolkit_0.0.14-6_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
FASTQ/A short nucleotide reads pre-processing tools
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | fastx-toolkit |
| نام فایل بسته | fastx-toolkit_0.0.14-6_amd64.deb |
| نسخه بسته | 0.0.14 |
| انتشار بسته | 6 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 112440 |
| حجم نصب | 615 |
The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for preprocessing
short nucleotide reads in FASTA and FASTQ formats, usually produced by
Next-Generation sequencing machines. The main processing of such FASTA/FASTQ
files is mapping (aligning) the sequences to reference genomes or other
databases using specialized programs like BWA, Bowtie and many others.
However, it is sometimes more productive to preprocess the FASTA/FASTQ files
before mapping the sequences to the genome—manipulating the sequences to
produce better mapping results. The FASTX-Toolkit tools perform some of these
preprocessing tasks.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| fastx-toolkit_0.0.14-6_arm64.deb | 0.0.14 | arm64 | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_armel.deb | 0.0.14 | armel | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_armhf.deb | 0.0.14 | armhf | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_i386.deb | 0.0.14 | i386 | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_mips.deb | 0.0.14 | mips | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_mips64el.deb | 0.0.14 | mips64el | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_mipsel.deb | 0.0.14 | mipsel | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_ppc64el.deb | 0.0.14 | ppc64el | Debian main |
| fastx-toolkit_0.0.14-6_s390x.deb | 0.0.14 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.14 | libc6 |
| >= 1:3.0 | libgcc1 |
| - | libgtextutils0v5 |
| >= 5.2 | libstdc++6 |
| - | libgd-graph-perl |
| - | libperlio-gzip-perl |
نحوه نصب
نصب پکیج deb fastx-toolkit:
sudo apt-get install fastx-toolkit_0.0.14-6_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/fasta_clipping_histogram.pl |
| ./usr/bin/fasta_formatter |
| ./usr/bin/fasta_nucleotide_changer |
| ./usr/bin/fastq_masker |
| ./usr/bin/fastq_quality_boxplot_graph.sh |
| ./usr/bin/fastq_quality_converter |
| ./usr/bin/fastq_quality_filter |
| ./usr/bin/fastq_quality_trimmer |
| ./usr/bin/fastq_to_fasta |
| ./usr/bin/fastx_artifacts_filter |
| ./usr/bin/fastx_barcode_splitter.pl |
| ./usr/bin/fastx_clipper |
| ./usr/bin/fastx_collapser |
| ./usr/bin/fastx_nucleotide_distribution_graph.sh |
| ./usr/bin/fastx_nucleotide_distribution_line_graph.sh |
| ./usr/bin/fastx_quality_stats |
| ./usr/bin/fastx_renamer |
| ./usr/bin/fastx_reverse_complement |
| ./usr/bin/fastx_trimmer |
| ./usr/bin/fastx_uncollapser |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/NEWS.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/README.Debian |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/README.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/README.test |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/THANKS |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/copyright |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/Makefile.am |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/Makefile.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/Makefile.in.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_collapser1.fasta |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_collapser1.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_formatter1.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_formatter1.out.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_formatter2.out.gz |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_nuc_changer1.fasta |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_nuc_changer1.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_nuc_changer2.fasta |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_nuc_changer2.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_uncollapser1.fasta |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fasta_uncollapser1.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_masker.fastq |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_masker.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_qual_conv1.fastq |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_qual_conv1.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_qual_conv1a.out |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_qual_conv2.fastq |
| ./usr/share/doc/fastx-toolkit/test-data/fastq_qual_conv2.out |
| ... and 57 more |