معرفی شرکت ها

rapmap_0.12.0+dfsg-3+b1_mips64el.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

rapid sensitive and accurate DNA read mapping via quasi-mapping
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main mips64el
نام بسته rapmap
نام فایل بسته rapmap_0.12.0+dfsg-3+b1_mips64el.deb
نسخه بسته 0.12.0+dfsg
انتشار بسته 3+b1
معماری بسته mips64el
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/COMBINE-lab/RapMap
مجوز -
حجم دانلود 688856
حجم نصب 3441
RapMap is a testing ground for ideas in quasi-mapping / (lightweight / pseudo) transcriptome alignment. That means that, at this point, it is somewhat experimental. The develop branch will have the latest improvements and additions, but is not guaranteed to be stable between commits. Breaking changes to the master branch will be accompanied by a tag to the version before the breaking change. Currently, RapMap is a stand-alone quasi-mapper that can be used with other tools. It is also being used as part of Sailfish and Salmon. Eventually, the hope is to create and stabilize an API so that it can be used as a library from other tools. . Quasi-mapping / (lightweight / pseudo)-alignment is the term that is used here for the type of information required for certain tasks (e.g. transcript quantification) that is less "heavyweight" than what is provided by traditional alignment. For example, one may only need to know the transcripts / contigs to which a read aligns and, perhaps, the position within those transcripts rather than the optimal alignment and base-for-base CIGAR string that aligns the read and substring of the transcript. For details on RapMap (quasi-mapping in particular), please check out the associated paper. Note: RapMap implements both quasi- mapping and pseudo-alignment (originally introduced in Bray et al. 2016), these two are not the same thing. They are distinct concepts, and RapMap simply happens to implement algorithms for computing both.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
rapmap-dev_0.12.0+dfsg-3_all.deb 0.12.0+dfsg all Debian main
rapmap-example-data_0.12.0+dfsg-3_all.deb 0.12.0+dfsg all Debian main
rapmap_0.12.0+dfsg-3+b1_amd64.deb 0.12.0+dfsg amd64 Debian main
rapmap_0.12.0+dfsg-3+b1_arm64.deb 0.12.0+dfsg arm64 Debian main
rapmap_0.12.0+dfsg-3+b1_ppc64el.deb 0.12.0+dfsg ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.4 libc6
>= 2.0.1 libdivsufsort3
>= 1:4.5 libgcc1
>= 5.0.0 libjemalloc2
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb rapmap:

    sudo apt-get install rapmap_0.12.0+dfsg-3+b1_mips64el.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/RunRapMap.sh
./usr/bin/rapmap
./usr/bin/rapmap_pseudoindex
./usr/share/doc/rapmap/README.html
./usr/share/doc/rapmap/TODO.Debian
./usr/share/doc/rapmap/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/rapmap/changelog.Debian.mips64el.gz
./usr/share/doc/rapmap/copyright
./usr/share/doc/rapmap/imgs/Join_Chat.svg
./usr/share/lintian/overrides/rapmap
./usr/share/man/man1/rapmap.1.gz
./usr/share/man/man1/rapmap_pseudoindex.1.gz
./usr/share/man/man1/rapmap_pseudomap.1.gz
./usr/share/man/man1/rapmap_quasiindex.1.gz
./usr/share/man/man1/rapmap_quasimap.1.gz
./usr/bin/rapmap_pseudomap -> rapmap_pseudoindex
./usr/bin/rapmap_quasiindex -> rapmap_pseudoindex
./usr/bin/rapmap_quasimap -> rapmap_pseudoindex