معرفی شرکت ها

dotter_4.44.1+dfsg-3_mips.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

detailed comparison of two genomic sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main mips
نام بسته dotter
نام فایل بسته dotter_4.44.1+dfsg-3_mips.deb
نسخه بسته 4.44.1+dfsg
انتشار بسته 3
معماری بسته mips
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.sanger.ac.uk/science/tools/seqtools
مجوز -
حجم دانلود 214260
حجم نصب 472
Dotter is a graphical dot-matrix program for detailed comparison of two sequences. . * Every residue in one sequence is compared to every residue in the other, and a matrix of scores is calculated. * One sequence is plotted on the x-axis and the other on the y-axis. * Noise is filtered out so that alignments appear as diagonal lines. * Pairwise scores are averaged over a sliding window to make the score matrix more intelligible. * The averaged score matrix forms a three-dimensional landscape, with the two sequences in two dimensions and the height of the peaks in the third. This landscape is projected onto two dimensions using a grey-scale image - the darker grey of a peak, the higher the score is. * The contrast and threshold of the grey-scale image can be adjusted interactively, without having to recalculate the score matrix. * An Alignment Tool is provided to examine the sequence alignment that the grey-scale image represents. * Known high-scoring pairs can be loaded from a GFF file and overlaid onto the plot. * Gene models can be loaded from GFF and displayed alongside the relevant axis. * Compare a sequence against itself to find internal repeats. * Find overlaps between multiple sequences by making a dot-plot of all sequences versus themselves. * Run Dotter in batch mode to create large, time-consuming dot-plots as a background process.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
dotter_4.44.1+dfsg-3_amd64.deb 4.44.1+dfsg amd64 Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_arm64.deb 4.44.1+dfsg arm64 Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_armel.deb 4.44.1+dfsg armel Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_armhf.deb 4.44.1+dfsg armhf Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_i386.deb 4.44.1+dfsg i386 Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_mips64el.deb 4.44.1+dfsg mips64el Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_mipsel.deb 4.44.1+dfsg mipsel Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_ppc64el.deb 4.44.1+dfsg ppc64el Debian main
dotter_4.44.1+dfsg-3_s390x.deb 4.44.1+dfsg s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 1.12.4 libatk1.0-0
>= 2.7 libc6
>= 1.2.4 libcairo2
>= 7.16.2 libcurl4
>= 2.12.6 libfontconfig1
>= 2.2.1 libfreetype6
- libgbtools0
>= 1:3.0 libgcc1
>= 2.22.0 libgdk-pixbuf2.0-0
>= 2.22.0 libglib2.0-0
>= 2.12.0 libgtk2.0-0
>= 1.7.4 libjsoncpp1
>= 1.14.0 libpango-1.0-0
>= 1.14.0 libpangocairo-1.0-0
>= 1.14.0 libpangoft2-1.0-0
>= 5.2 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb dotter:

    sudo apt-get install dotter_4.44.1+dfsg-3_mips.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/dotter
./usr/share/doc/dotter/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/dotter/changelog.gz
./usr/share/doc/dotter/copyright
./usr/share/man/man1/dotter.1.gz