معرفی شرکت ها

freecontact_1.0.21-7+b1_mipsel.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

fast protein contact predictor
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main mipsel
نام بسته freecontact
نام فایل بسته freecontact_1.0.21-7+b1_mipsel.deb
نسخه بسته 1.0.21
انتشار بسته 7+b1
معماری بسته mipsel
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://rostlab.org/
مجوز -
حجم دانلود 338752
حجم نصب 2121
FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011). . FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible. . A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input. . jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example. . This package contains the command line tool freecontact(1).


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
freecontact_1.0.21-7+b1_amd64.deb 1.0.21 amd64 Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_arm64.deb 1.0.21 arm64 Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_armel.deb 1.0.21 armel Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_armhf.deb 1.0.21 armhf Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_i386.deb 1.0.21 i386 Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_mips.deb 1.0.21 mips Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_mips64el.deb 1.0.21 mips64el Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_ppc64el.deb 1.0.21 ppc64el Debian main
freecontact_1.0.21-7+b1_s390x.deb 1.0.21 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- libboost-program-options1.67.0
>= 2.4 libc6
- libfreecontact0v5
>= 1:3.0 libgcc1
>= 4.2.1 libgomp1
>= 5.2 libstdc++6
- libxerces-c3.2
- perl:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb freecontact:

    sudo apt-get install freecontact_1.0.21-7+b1_mipsel.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/freecontact
./usr/share/bash-completion/completions/freecontact.bash-completion
./usr/share/doc/freecontact/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/freecontact/changelog.Debian.mipsel.gz
./usr/share/doc/freecontact/changelog.gz
./usr/share/doc/freecontact/copyright
./usr/share/doc/freecontact/examples/PF00071_v25_999.evfold.50
./usr/share/doc/freecontact/examples/PF00071_v25_999.evfold.50.xml.gz
./usr/share/doc/freecontact/examples/PF00071_v25_999.fa
./usr/share/doc/freecontact/examples/PF00071_v25_999.xml
./usr/share/doc/freecontact/examples/demo_1000.aln
./usr/share/doc/freecontact/examples/demo_1000.psicov.50
./usr/share/freecontact/BioXSD-1.1.xsd
./usr/share/freecontact/a2m2aln
./usr/share/freecontact/freecontact_input.xsd
./usr/share/freecontact/freecontact_output.xsd
./usr/share/man/man1/freecontact.1.gz