معرفی شرکت ها
staden-io-lib-examples_1.14.11-6_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
programs for manipulating DNA sequencing files (usage examples)
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | staden-io-lib-examples |
| نام فایل بسته | staden-io-lib-examples_1.14.11-6_all.deb |
| نسخه بسته | 1.14.11 |
| انتشار بسته | 6 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/jkbonfield/io_lib |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 2750176 |
| حجم نصب | 2813 |
The io_lib from the Staden package is a library of file reading and writing
code to provide a general purpose trace file (and Experiment File) reading
interface. It has been compiled and tested on a variety of unix systems,
MacOS X and MS Windows.
.
This package contains the programs that are distributed with the Staden io_lib
for manipulating and converting sequencing data files, and in particular files
to maniuplate short reads generated by second and third generation sequencers
and stored in SRF format.
.
This package contains example data and a test suite to test the data.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - |
نحوه نصب
نصب پکیج deb staden-io-lib-examples:
sudo apt-get install staden-io-lib-examples_1.14.11-6_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/compare_sam.pl |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/cram_io.test |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/9827_rand3.cram.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/9827_rand3.sam.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.info |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/4_ILLUMINA_GA_BUSTARD_PARAMS.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/4_ILLUMINA_GA_CHASTITY.txt |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/4_ILLUMINA_GA_FIRECREST_PARAMS.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/4_ILLUMINA_GA_MATRIX_FWD.txt |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/4_ILLUMINA_GA_PHASING_FWD.txt |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/4_PROGRAM_ID.txt |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0133_int.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0133_nse.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0133_prb.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0133_seq.txt |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0133_sig2.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0134_int.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0134_nse.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0134_prb.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0134_seq.txt |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.run/s_4_0134_sig2.txt.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/both.srf.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1#bounds.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1#clip.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1#pad1.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1#pad2.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1#pad3.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1.fa |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/c1.fa.fai |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#1.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#2.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#5.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#5b.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#5b_java.cram.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#5b_java.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#large_seq.sam.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#tag_depadded.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#tag_padded.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#unmap.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#unmap1.sam |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce#unmap2.sam.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce.fa.fai |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/ce.fa.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/proc.info |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/proc.srf.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/proc.srf.indexed.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/raw.info |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/raw.srf.gz |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/slx-C.fasta |
| ./usr/share/doc/staden-io-lib/test/data/slx-C.fastq |
| ... and 40 more |