معرفی شرکت ها
r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_armhf.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
transcript expression inference and analysis for RNA-seq data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main armhf |
| نام بسته | r-bioc-bitseq |
| نام فایل بسته | r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_armhf.deb |
| نسخه بسته | 1.26.1+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | armhf |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/BitSeq/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 949892 |
| حجم نصب | 5369 |
The BitSeq package is targeted for transcript expression
analysis and differential expression analysis of RNA-seq data
in two stage process. In the first stage it uses Bayesian
inference methodology to infer expression of individual
transcripts from individual RNA-seq experiments. The second
stage of BitSeq embraces the differential expression analysis
of transcript expression. Providing expression estimates from
replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the
estimates is used for inferring the condition mean transcript
expression and ranking the transcripts based on the likelihood
of differential expression.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_amd64.deb | 1.26.1+dfsg | amd64 | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_arm64.deb | 1.26.1+dfsg | arm64 | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_armel.deb | 1.26.1+dfsg | armel | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_i386.deb | 1.26.1+dfsg | i386 | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_mips.deb | 1.26.1+dfsg | mips | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_mips64el.deb | 1.26.1+dfsg | mips64el | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_mipsel.deb | 1.26.1+dfsg | mipsel | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_ppc64el.deb | 1.26.1+dfsg | ppc64el | Debian main |
| r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_s390x.deb | 1.26.1+dfsg | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3.5.2-1 | r-base-core |
| - | r-api-3.5 |
| - | r-api-bioc-3.8 |
| - | r-bioc-rsamtools |
| - | r-bioc-zlibbioc |
| - | r-bioc-s4vectors |
| - | r-bioc-iranges |
| >= 2.23 | libc6 |
| >= 1:3.5 | libgcc1 |
| >= 4.9 | libgomp1 |
| >= 5.2 | libstdc++6 |
| >= 1:1.2.3.3 | zlib1g |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-bitseq:
sudo apt-get install r-bioc-bitseq_1.26.1+dfsg-1_armhf.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/R/BitSeq |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/R/BitSeq.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/R/BitSeq.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/BitSeq.R |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/BitSeq.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/BitSeq.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c0b0.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c0b1.rpkm |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c1b0.rpkm |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c1b1.rpkm |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/ensSelect1.fasta |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/ensSelect1.tr |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/parameters1.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/BitSeq.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/BitSeq.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/BitSeq/libs/BitSeq.so |
| ./usr/share/doc/r-bioc-bitseq/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-bitseq/copyright |
| ./usr/share/lintian/overrides/r-bioc-bitseq |