معرفی شرکت ها

phast_1.4+dfsg-1_i386.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

phylogenetic analysis with space/time models
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main i386
نام بسته phast
نام فایل بسته phast_1.4+dfsg-1_i386.deb
نسخه بسته 1.4+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته i386
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://compgen.cshl/edu/phast
مجوز -
حجم دانلود 2300256
حجم نصب 30268
PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences. . PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
phast_1.4+dfsg-1_amd64.deb 1.4+dfsg amd64 Debian main
phast_1.4+dfsg-1_arm64.deb 1.4+dfsg arm64 Debian main
phast_1.4+dfsg-1_armel.deb 1.4+dfsg armel Debian main
phast_1.4+dfsg-1_armhf.deb 1.4+dfsg armhf Debian main
phast_1.4+dfsg-1_mips.deb 1.4+dfsg mips Debian main
phast_1.4+dfsg-1_mips64el.deb 1.4+dfsg mips64el Debian main
phast_1.4+dfsg-1_mipsel.deb 1.4+dfsg mipsel Debian main
phast_1.4+dfsg-1_ppc64el.deb 1.4+dfsg ppc64el Debian main
phast_1.4+dfsg-1_s390x.deb 1.4+dfsg s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- libblas3 | libblas.so.3
>= 2.23 libc6
- liblapack3 | liblapack.so.3
- libpcre3
- libtmglib3


نحوه نصب


نصب پکیج deb phast:

    sudo apt-get install phast_1.4+dfsg-1_i386.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/all_dists
./usr/bin/base_evolve
./usr/bin/chooseLines
./usr/bin/clean_genes
./usr/bin/consEntropy
./usr/bin/convert_coords
./usr/bin/display_rate_matrix
./usr/bin/dless
./usr/bin/dlessP
./usr/bin/draw_tree
./usr/bin/eval_predictions
./usr/bin/exoniphy
./usr/bin/hmm_train
./usr/bin/hmm_tweak
./usr/bin/hmm_view
./usr/bin/indelFit
./usr/bin/indelHistory
./usr/bin/maf_parse
./usr/bin/makeHKY
./usr/bin/modFreqs
./usr/bin/msa_diff
./usr/bin/msa_split
./usr/bin/msa_view
./usr/bin/pbsDecode
./usr/bin/pbsEncode
./usr/bin/pbsScoreMatrix
./usr/bin/pbsTrain
./usr/bin/phast
./usr/bin/phastBias
./usr/bin/phastCons
./usr/bin/phastMotif
./usr/bin/phastOdds
./usr/bin/phyloBoot
./usr/bin/phyloFit
./usr/bin/phyloP
./usr/bin/prequel
./usr/bin/refeature
./usr/bin/stringiphy
./usr/bin/treeGen
./usr/bin/tree_doctor
./usr/share/doc/phast/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/phast/copyright
./usr/share/man/man1/all_dists.1.gz
./usr/share/man/man1/base_evolve.1.gz
./usr/share/man/man1/chooseLines.1.gz
./usr/share/man/man1/clean_genes.1.gz
./usr/share/man/man1/consEntropy.1.gz
./usr/share/man/man1/convert_coords.1.gz
./usr/share/man/man1/display_rate_matrix.1.gz
./usr/share/man/man1/dless.1.gz
... and 116 more