معرفی شرکت ها


abyss_2.1.5-7_i386.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

de novo, parallel, sequence assembler for short reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main i386
نام بسته abyss
نام فایل بسته abyss_2.1.5-7_i386.deb
نسخه بسته 2.1.5
انتشار بسته 7
معماری بسته i386
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss
مجوز -
حجم دانلود 3031836
حجم نصب 9334
ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
abyss_2.1.5-7_amd64.deb 2.1.5 amd64 Debian main
abyss_2.1.5-7_arm64.deb 2.1.5 arm64 Debian main
abyss_2.1.5-7_armel.deb 2.1.5 armel Debian main
abyss_2.1.5-7_armhf.deb 2.1.5 armhf Debian main
abyss_2.1.5-7_mips64el.deb 2.1.5 mips64el Debian main
abyss_2.1.5-7_mipsel.deb 2.1.5 mipsel Debian main
abyss_2.1.5-7_ppc64el.deb 2.1.5 ppc64el Debian main
abyss_2.1.5-7_s390x.deb 2.1.5 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- make
>= 2.28 libc6
>= 1:4.2 libgcc1
>= 4.9 libgomp1
- libopenmpi3
>= 3.5.9 libsqlite3-0
>= 5.2 libstdc++6
- perl:any
- bsdmainutils
- openmpi-common
- openmpi-bin


نحوه نصب


نصب پکیج deb abyss:

    sudo apt-get install abyss_2.1.5-7_i386.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/DistanceEst
./usr/bin/abyss-fixmate
./usr/bin/abyss-pe
./usr/lib/abyss/ABYSS
./usr/lib/abyss/ABYSS-P
./usr/lib/abyss/AdjList
./usr/lib/abyss/Consensus
./usr/lib/abyss/DAssembler
./usr/lib/abyss/DistanceEst
./usr/lib/abyss/DistanceEst-ssq
./usr/lib/abyss/KAligner
./usr/lib/abyss/MergeContigs
./usr/lib/abyss/MergePaths
./usr/lib/abyss/Overlap
./usr/lib/abyss/ParseAligns
./usr/lib/abyss/PathConsensus
./usr/lib/abyss/PathOverlap
./usr/lib/abyss/PopBubbles
./usr/lib/abyss/SimpleGraph
./usr/lib/abyss/abyss-align
./usr/lib/abyss/abyss-bloom
./usr/lib/abyss/abyss-bloom-dbg
./usr/lib/abyss/abyss-bloom-dist.mk
./usr/lib/abyss/abyss-bowtie
./usr/lib/abyss/abyss-bowtie2
./usr/lib/abyss/abyss-bwa
./usr/lib/abyss/abyss-bwamem
./usr/lib/abyss/abyss-bwasw
./usr/lib/abyss/abyss-db-csv
./usr/lib/abyss/abyss-db-txt
./usr/lib/abyss/abyss-dida
./usr/lib/abyss/abyss-fac
./usr/lib/abyss/abyss-fatoagp
./usr/lib/abyss/abyss-filtergraph
./usr/lib/abyss/abyss-fixmate
./usr/lib/abyss/abyss-fixmate-ssq
./usr/lib/abyss/abyss-gapfill
./usr/lib/abyss/abyss-gc
./usr/lib/abyss/abyss-index
./usr/lib/abyss/abyss-junction
./usr/lib/abyss/abyss-kaligner
./usr/lib/abyss/abyss-layout
./usr/lib/abyss/abyss-longseqdist
./usr/lib/abyss/abyss-map
./usr/lib/abyss/abyss-map-ssq
./usr/lib/abyss/abyss-mergepairs
./usr/lib/abyss/abyss-overlap
./usr/lib/abyss/abyss-paired-dbg
./usr/lib/abyss/abyss-paired-dbg-mpi
./usr/lib/abyss/abyss-pe
... and 29 more