معرفی شرکت ها

topp_2.4.0-real-1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main amd64
نام بسته topp
نام فایل بسته topp_2.4.0-real-1_amd64.deb
نسخه بسته 2.4.0
انتشار بسته real
معماری بسته amd64
نگهدارنده The Debichem Group <debichem-devel@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.openms.de
مجوز -
حجم دانلود 2720140
حجم نصب 15117
TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are : . - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data. - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design. - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several files in DTA format. - FileConverter: Converts between different MS file formats. - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak, feature or consensus feature files. - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by precursor or by RT blocks. - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a top-hat filter. - InternalCalibration: Applies an internal calibration. - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic peptides from a training set. - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model trained by RTModel. - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
topp_2.4.0-real-1_arm64.deb 2.4.0 arm64 Debian main
topp_2.4.0-real-1_i386.deb 2.4.0 i386 Debian main
topp_2.4.0-real-1_mips.deb 2.4.0 mips Debian main
topp_2.4.0-real-1_mips64el.deb 2.4.0 mips64el Debian main
topp_2.4.0-real-1_mipsel.deb 2.4.0 mipsel Debian main
topp_2.4.0-real-1_ppc64el.deb 2.4.0 ppc64el Debian main
topp_2.4.0-real-1_s390x.deb 2.4.0 s390x Debian main
toppler_1.1.6-3_amd64.deb 1.1.6 amd64 Debian main
toppler_1.1.6-3_arm64.deb 1.1.6 arm64 Debian main
toppler_1.1.6-3_armel.deb 1.1.6 armel Debian main
toppler_1.1.6-3_armhf.deb 1.1.6 armhf Debian main
toppler_1.1.6-3_i386.deb 1.1.6 i386 Debian main
toppler_1.1.6-3_mips.deb 1.1.6 mips Debian main
toppler_1.1.6-3_mips64el.deb 1.1.6 mips64el Debian main
toppler_1.1.6-3_mipsel.deb 1.1.6 mipsel Debian main
toppler_1.1.6-3_ppc64el.deb 1.1.6 ppc64el Debian main
toppler_1.1.6-3_s390x.deb 1.1.6 s390x Debian main
toppred_1.10-7_amd64.deb 1.10 amd64 Debian main
toppred_1.10-7_arm64.deb 1.10 arm64 Debian main
toppred_1.10-7_armel.deb 1.10 armel Debian main
toppred_1.10-7_armhf.deb 1.10 armhf Debian main
toppred_1.10-7_i386.deb 1.10 i386 Debian main
toppred_1.10-7_mips.deb 1.10 mips Debian main
toppred_1.10-7_mips64el.deb 1.10 mips64el Debian main
toppred_1.10-7_mipsel.deb 1.10 mipsel Debian main
toppred_1.10-7_ppc64el.deb 1.10 ppc64el Debian main
toppred_1.10-7_s390x.deb 1.10 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- coinor-libcbc3
- coinor-libcgl1
- coinor-libclp1
- coinor-libcoinutils3v5
- coinor-libosi1v5
- libboost-date-time1.67.0
- libboost-iostreams1.67.0
- libboost-math1.67.0
>= 1.67.0-10 libboost-regex1.67.0
- libbz2-1.0
>= 2.14 libc6
>= 1:3.0 libgcc1
>= 4.59 libglpk40
>= 4.9 libgomp1
= 2.4.0-real-1 libopenms2.4.0
>= 5.11.0~rc1 libqt5core5a
>= 5.8.0 libqt5gui5
>= 5.7.0 libqt5network5
>= 5.6.0~beta libqt5svg5
>= 5.7.0 libqt5widgets5
>= 3.5.9 libsqlite3-0
>= 5.2 libstdc++6
- libsvm3
>= 5.13 libwildmagic5
- libxerces-c3.2
>= 1:1.1.4 zlib1g
= 2.4.0-real-1 openms-common


نحوه نصب


نصب پکیج deb topp:

    sudo apt-get install topp_2.4.0-real-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/AccurateMassSearch
./usr/bin/AssayGeneratorMetabo
./usr/bin/BaselineFilter
./usr/bin/CVInspector
./usr/bin/ClusterMassTraces
./usr/bin/ClusterMassTracesByPrecursor
./usr/bin/CometAdapter
./usr/bin/CompNovo
./usr/bin/CompNovoCID
./usr/bin/ConsensusID
./usr/bin/ConsensusMapNormalizer
./usr/bin/CruxAdapter
./usr/bin/DTAExtractor
./usr/bin/DatabaseFilter
./usr/bin/DeMeanderize
./usr/bin/Decharger
./usr/bin/DecoyDatabase
./usr/bin/Digestor
./usr/bin/DigestorMotif
./usr/bin/EICExtractor
./usr/bin/ERPairFinder
./usr/bin/ExecutePipeline
./usr/bin/ExternalCalibration
./usr/bin/FFEval
./usr/bin/FalseDiscoveryRate
./usr/bin/FeatureFinderCentroided
./usr/bin/FeatureFinderIdentification
./usr/bin/FeatureFinderIsotopeWavelet
./usr/bin/FeatureFinderMRM
./usr/bin/FeatureFinderMetabo
./usr/bin/FeatureFinderMultiplex
./usr/bin/FeatureFinderSuperHirn
./usr/bin/FeatureLinkerLabeled
./usr/bin/FeatureLinkerUnlabeled
./usr/bin/FeatureLinkerUnlabeledKD
./usr/bin/FeatureLinkerUnlabeledQT
./usr/bin/FidoAdapter
./usr/bin/FileConverter
./usr/bin/FileFilter
./usr/bin/FileInfo
./usr/bin/FileMerger
./usr/bin/FuzzyDiff
./usr/bin/GenericWrapper
./usr/bin/HighResPrecursorMassCorrector
./usr/bin/IDConflictResolver
./usr/bin/IDDecoyProbability
./usr/bin/IDExtractor
./usr/bin/IDFileConverter
./usr/bin/IDFilter
./usr/bin/IDMapper
... and 301 more