معرفی شرکت ها


libvcflib-tools_1.0.0~rc2+dfsg-2_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main amd64
نام بسته libvcflib-tools
نام فایل بسته libvcflib-tools_1.0.0~rc2+dfsg-2_amd64.deb
نسخه بسته 1.0.0~rc2+dfsg
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/ekg/vcflib
مجوز -
حجم دانلود 629360
حجم نصب 4185
The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors. . vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both: . * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can be described by the VCF format, * and a collection of command-line utilities for executing complex manipulations on VCF files. . This package contains several tools using the library.


نیازمندی

مقدار نام
- libbz2-1.0
>= 2.23 libc6
>= 0.0.2 libdisorder0
>= 0.0+git20160702.bbc645f libfastahack0
>= 1:3.0 libgcc1
>= 1.0 libhts2
>= 5.1.1alpha+20110809 liblzma5
>= 0.0+git20160702.2610e25 libsmithwaterman0
>= 5.2 libstdc++6
- libtabixpp0
- libvcflib1
>= 1:1.1.4 zlib1g
- python
- r-base-core
- r-cran-plyr
- r-cran-ggplot2
- r-cran-gridbase


نحوه نصب


نصب پکیج deb libvcflib-tools:

    sudo apt-get install libvcflib-tools_1.0.0~rc2+dfsg-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/vcflib
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotBfst.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotHapLrt.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotHaplotypes.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotPfst.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotSmoothed.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotWCfst.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotXPEHH.R
./usr/lib/vcflib/bin/abba-baba
./usr/lib/vcflib/bin/bFst
./usr/lib/vcflib/bin/bed2region
./usr/lib/vcflib/bin/bgziptabix
./usr/lib/vcflib/bin/dumpContigsFromHeader
./usr/lib/vcflib/bin/genotypeSummary
./usr/lib/vcflib/bin/hapLrt
./usr/lib/vcflib/bin/iHS
./usr/lib/vcflib/bin/meltEHH
./usr/lib/vcflib/bin/normalize-iHS
./usr/lib/vcflib/bin/pFst
./usr/lib/vcflib/bin/pVst
./usr/lib/vcflib/bin/permuteGPAT++
./usr/lib/vcflib/bin/permuteSmooth
./usr/lib/vcflib/bin/plotHaps
./usr/lib/vcflib/bin/plot_roc.r
./usr/lib/vcflib/bin/popStats
./usr/lib/vcflib/bin/segmentFst
./usr/lib/vcflib/bin/segmentIhs
./usr/lib/vcflib/bin/sequenceDiversity
./usr/lib/vcflib/bin/smoother
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2bed.py
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2dag
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2fasta
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2sqlite.py
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2tsv
./usr/lib/vcflib/bin/vcf_strip_extra_headers
./usr/lib/vcflib/bin/vcfaddinfo
./usr/lib/vcflib/bin/vcfafpath
./usr/lib/vcflib/bin/vcfallelicprimitives
./usr/lib/vcflib/bin/vcfaltcount
./usr/lib/vcflib/bin/vcfannotate
./usr/lib/vcflib/bin/vcfannotategenotypes
./usr/lib/vcflib/bin/vcfbiallelic
./usr/lib/vcflib/bin/vcfbreakmulti
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcat
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcheck
./usr/lib/vcflib/bin/vcfclassify
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcleancomplex
./usr/lib/vcflib/bin/vcfclearid
./usr/lib/vcflib/bin/vcfclearinfo
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcombine
... and 87 more