معرفی شرکت ها


giira_0.0.20140625-2_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

RNA-Seq driven gene finding incorporating ambiguous reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main amd64
نام بسته giira
نام فایل بسته giira_0.0.20140625-2_amd64.deb
نسخه بسته 0.0.20140625
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://sourceforge.net/projects/giira/
مجوز -
حجم دانلود 143492
حجم نصب 172
GIIRA is a gene prediction method that identifies potential coding regions exclusively based on the mapping of reads from an RNA-Seq experiment. It was foremost designed for prokaryotic gene prediction and is able to resolve genes within the expressed region of an operon. However, it is also applicable to eukaryotes and predicts exon intron structures as well as alternative isoforms.


نیازمندی

مقدار نام
- libglpk-java
- glpk-utils
- bowtie2
- tophat


نحوه نصب


نصب پکیج deb giira:

    sudo apt-get install giira_0.0.20140625-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/giira
./usr/share/doc/giira/README.Debian
./usr/share/doc/giira/README.test
./usr/share/doc/giira/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/giira/copyright
./usr/share/giira/scripts/bwa_aln.py
./usr/share/giira/scripts/bwa_index.py
./usr/share/giira/scripts/bwa_samse.py
./usr/share/giira/scripts/bwa_sw.py
./usr/share/giira/scripts/callCat.py
./usr/share/giira/scripts/callCat_RnaFile.py
./usr/share/giira/scripts/filterGenes.py
./usr/share/giira/scripts/getMeanCov.py
./usr/share/giira/scripts/lpCall.py
./usr/share/giira/scripts/sortReaSam.py
./usr/share/java/giira-0.0.20140625.jar
./usr/share/man/man1/giira.1.gz
./usr/share/java/giira.jar -> giira-0.0.20140625.jar