معرفی شرکت ها

gasic_0.0.r19-4_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

genome abundance similarity correction
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main amd64
نام بسته gasic
نام فایل بسته gasic_0.0.r19-4_amd64.deb
نسخه بسته 0.0.r19
انتشار بسته 4
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://sourceforge.net/projects/gasic/
مجوز -
حجم دانلود 20260
حجم نصب 74
One goal of sequencing based metagenomic analysis is the quantitative taxonomic assessment of microbial community compositions. However, the majority of approaches either quantify at low resolution (e.g. at phylum level) or have severe problems discerning highly similar species. Yet, accurate quantification on species level is desirable in applications such as metagenomic diagnostics or community comparison. GASiC is a method to correct read alignment results for the ambiguities imposed by similarities of genomes. It has superior performance over existing methods.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.6.6-7~ python:any
- python-scipy
- python-numpy
- python-biopython
- python-pysam
- python-matplotlib
- bowtie
- bowtie2
- bwa
- seqan-apps


نحوه نصب


نصب پکیج deb gasic:

    sudo apt-get install gasic_0.0.r19-4_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/doc/gasic/MANUAL.gz
./usr/share/doc/gasic/README.gz
./usr/share/doc/gasic/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/gasic/copyright
./usr/share/doc/gasic/examples/README.example
./usr/share/doc/gasic/examples/example_script.py.gz
./usr/share/gasic/core/__init__.py
./usr/share/gasic/core/gasic.py
./usr/share/gasic/core/tools.py
./usr/share/gasic/correct_abundances.py
./usr/share/gasic/create_matrix.py
./usr/share/gasic/quality_check.py
./usr/share/gasic/run_mappers.py
./usr/share/man/man1/correct_abundances.1.gz
./usr/share/man/man1/create_matrix.1.gz
./usr/share/man/man1/quality_check.1.gz
./usr/share/man/man1/run_mappers.1.gz
./usr/share/python/runtime.d/gasic.rtupdate
./usr/bin/correct_abundances -> ../share/gasic/correct_abundances.py
./usr/bin/create_matrix -> ../share/gasic/create_matrix.py
./usr/bin/quality_check -> ../share/gasic/quality_check.py
./usr/bin/run_mappers -> ../share/gasic/run_mappers.py