معرفی شرکت ها
profphd_1.0.42-3_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
secondary structure and solvent accessibility predictor
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | profphd |
| نام فایل بسته | profphd_1.0.42-3_all.deb |
| نسخه بسته | 1.0.42 |
| انتشار بسته | 3 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://predictprotein.org/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 4510400 |
| حجم نصب | 26199 |
This package provides prof(1), the protein secondary structure, accessibility
and transmembrane helix predictor from Burkhard Rost. Prediction is either
done from protein sequence alone or from an alignment - the latter should be
used for optimal performance.
.
How well does prof(1) perform?
.
* Secondary structure is predicted at an expected average accuracy > 72% for
the three states helix, strand and loop.
.
* Solvent accessibility is predicted at a correlation coefficient
(correlation between experimentally observed and predicted relative
solvent accessibility) of 0.54
.
* Transmembrane helix prediction has an expected per-residue accuracy of
about 95%. The number of false positives, i.e., transmembrane helices
predicted in globular proteins, is about 2%.
جایگزین ها
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | perl:any |
| - | librg-utils-perl |
| - | profnet-prof |
| - | profphd-utils |
| - | profphd-net |
نحوه نصب
نصب پکیج deb profphd:
sudo apt-get install profphd_1.0.42-3_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/profphd/AUTHORS |
| ./usr/share/doc/profphd/README.Debian |
| ./usr/share/doc/profphd/README.gz |
| ./usr/share/doc/profphd/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/profphd/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/profphd/copyright |
| ./usr/share/man/man1/prof.1.gz |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/Doc-phd-code.pl |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/Maxhom_Blosum.metric |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/Maxhom_GCG.metric |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/Maxhom_McLachlan.metric |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/Maxhom_Sec_Struc.metric |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/Maxhom_Struc_IO.metric |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/__THESE_METRIC_FILES_ARE_IDENTICAL_TO_THOSE_IN_PROF-MAT__ |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/abbrPhd3.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/abbrPhdAcc.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/abbrPhdBoth.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/abbrPhdHtm.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/abbrPhdRdb3.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/abbrPhdSec.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/headPhd3.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/headPhdAcc.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/headPhdBoth.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/headPhdConcise.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/headPhdHtm.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/headPhdSec.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/help-manual.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/mat/help-options.txt |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-15rc.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-15rcc.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-15rccld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-15rcic.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-15rcicld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-w9-15rccld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-w9-15rcic.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp152x-w9-15rcicld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-15rccld-A1.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-15rccld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-15rcic-A1.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-15rcic.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-15rcicld-A1.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-15rcicld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-w9-15rccld-A1.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-w9-15rccld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-w9-15rcicld-A1.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp252x-w9-15rcicld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp317x-15rccld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp317x-15rcic.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp317x-15rcicld.DAT |
| ./usr/share/profphd/prof/embl/net/Exp317x-w9-15rccld.DAT |
| ... and 404 more |