معرفی شرکت ها
metastudent_2.0.1-6_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | metastudent |
| نام فایل بسته | metastudent_2.0.1-6_all.deb |
| نسخه بسته | 2.0.1 |
| انتشار بسته | 6 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://rostlab.org/owiki/index.php/Metastudent |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 5994408 |
| حجم نصب | 94959 |
Often, only the sequence of a protein is known, but
not its functions. Metastudent will try to predict
missing functional annotations through homology searches (BLAST).
.
All predicted functions correspond to Gene Ontology (GO)
terms from the Molecular Function (MFO), the Biological Process
(BPO) and the Cellular Component Ontology (CCO) and are associated
with a reliability score.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| metastudent-data-2_1.0.0-4_all.deb | 1.0.0 | all | Debian main |
| metastudent-data_2.0.1-4_all.deb | 2.0.1 | all | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | perl:any |
| << 2.8 | python:any |
| >= 2.7~ | python:any |
| - | python |
| - | blast2 |
| - | default-jre |
| >= 0.15-3 | libgo-perl |
| - | libipc-run-perl |
| - | libgraphviz-perl |
| - | libfile-chdir-perl |
| >= 2.0.0 | metastudent-data |
نحوه نصب
نصب پکیج deb metastudent:
sudo apt-get install metastudent_2.0.1-6_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./etc/metastudentrc |
| ./usr/bin/metastudent |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudent-2.0.1.egg-info |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/BlastWrapper.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/Logger.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/__init__.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/commons.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/generateTermNameMapping.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/DataPreprocessing/splitDB.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GOSSIP/.classpath |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GOSSIP/.project |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GOSSIP/temp.fasta |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GO_Parser/GO_Parents.2014.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GO_Parser/GO_Parents.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GO_Parser/src/.classpath |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/GO_Parser/src/.project |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/Validation/GO_Table.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/Validation/SIMPLECOUNT_0.8.val |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/Validation/SIMPLECOUNT_0.9.val |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/parser/group2_blastParser.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/parser/group2_goParserSwissprot.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/parser/group2_goStatistics.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/parser/group4_blastParser.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/parser/group4_swissProtParser.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupA/report.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/data/besthit.dist |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/data/goterm2014.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/data/goterm2term.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/data/transitiveClosure2014.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/data/unweighted.dist |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/data/weighted.dist |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/java/META-INF/MANIFEST.MF |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/java/bla.tabularresults |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/GOaddpath.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/GOeval.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/GOfunctions.pm |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/GOmultifiles.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/addGO2BLAST.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/build_splitsets.rb |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/cafa_format_checker_2.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/call_build_splitsets.readme |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/evaluate.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/filter_fasta.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/go_filter_cc.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/make_percent.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/make_splits.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/parse_GO_hierarchy.xslt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/parse_GO_terms.xslt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/parse_blast.pl |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/metastudentPkg/lib/groupB/perl/readme.txt |
| ... and 38 more |