معرفی شرکت ها

mapdamage_2.0.9+dfsg-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main all
نام بسته mapdamage
نام فایل بسته mapdamage_2.0.9+dfsg-1_all.deb
نسخه بسته 2.0.9+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://ginolhac.github.io/mapDamage/
مجوز -
حجم دانلود 39592
حجم نصب 184
MapDamage is a computational framework written in Python and R, which tracks and quantifies DNA damage patterns among ancient DNA sequencing reads generated by Next-Generation Sequencing platforms. . MapDamage is developed at the Centre for GeoGenetics by the Orlando Group.


نیازمندی

مقدار نام
<< 2.8 python:any
>= 2.7~ python:any
- r-base-core
- r-cran-gam
- r-cran-ggplot2
- r-cran-inline
- seqtk
- python-pysam
- r-cran-rcpp
- r-cran-rcppgsl
- libopenblas-dev | libblas-dev | libatlas-base-dev | libblas.so
- libopenblas-dev | liblapack-dev | libatlas-base-dev | liblapack.so


نحوه نصب


نصب پکیج deb mapdamage:

    sudo apt-get install mapdamage_2.0.9+dfsg-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/mapDamage
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/lengths.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/mapDamage.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/checkLibraries.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/data.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/function.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/main.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/postConditonal.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/priorPropose.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/runGeneral.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/start.R
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/align.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/composition.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/parseoptions.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/rescale.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/rscript.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/seq.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/tables.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/version.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage-2.0.8.egg-info
./usr/share/doc/mapdamage/README.test
./usr/share/doc/mapdamage/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/mapdamage/copyright
./usr/share/doc/mapdamage/ref_T.fa
./usr/share/doc/mapdamage/run-r-packages-check
./usr/share/doc/mapdamage/run-unit-test
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/long_align/pe.sam
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/long_align/pe_output/Stats_out_MCMC_correct_prob.csv
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/long_align/ref.fa
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/pe_test/pe.sam
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/pe_test/pe_output/Stats_out_MCMC_correct_prob.csv
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/pe_test/pe_rescaled_correct.sam
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test/pe_test/ref.fa
./usr/share/doc/mapdamage/tests/rescale_test.py
./usr/share/man/man1/mapDamage.1.gz