معرفی شرکت ها
bowtie2-examples_2.3.4.3-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Examples for bowtie2
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Buster-10 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | bowtie2-examples |
| نام فایل بسته | bowtie2-examples_2.3.4.3-1_all.deb |
| نسخه بسته | 2.3.4.3 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2 |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 9717740 |
| حجم نصب | 9598 |
An ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads
to long reference sequences. It is particularly good at aligning reads
of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good
at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes.
.
Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint
small: for the human genome, its memory footprint is typically
around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes
.
This package provides some example data to work with bowtie2.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - |
نحوه نصب
نصب پکیج deb bowtie2-examples:
sudo apt-get install bowtie2-examples_2.3.4.3-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda_virus.1.bt2.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda_virus.2.bt2 |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda_virus.3.bt2 |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda_virus.4.bt2.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda_virus.rev.1.bt2.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda_virus.rev.2.bt2 |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reads/combined_reads.bam.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reads/conversion_utilities.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reads/longreads.fq.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reads/reads_1.fq.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reads/reads_2.fq.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reads/simulate.pl.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/reference/lambda_virus.fa.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/convert_quals.pl |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/gen_2b_occ_lookup.pl |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/gen_occ_lookup.pl.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/gen_solqual_lookup.pl |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/infer_fraglen.pl.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_a_thaliana_tair.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_b_taurus_UMD3.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_c_elegans.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_canFam2.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_d_melanogaster.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_e_coli.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_h_sapiens_ncbi36.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_h_sapiens_ncbi37.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_hg18.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_hg19.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_m_musculus_ncbi37.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_mm10.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_mm9.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_rn4.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/make_s_cerevisiae.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sa.py |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/AlignmentCheck.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/DNA.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/Mutate.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/RandDNA.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/SampleRead.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/Sim.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/Test.pm |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/contrib/ForkManager.pm.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/run.pl |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/run.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/sim/unit.sh |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/test/DNA.pm |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/test/README.md |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/test/benchmark/benchmarks.py.gz |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/test/benchmark/data/conf/acc.json |
| ./usr/share/doc/bowtie2/examples/scripts/test/benchmark/data/conf/seta.bench |
| ... and 16 more |