معرفی شرکت ها

bio-tradis_1.4.1+dfsg-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

analyse the output from TraDIS analyses of genomic sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Buster-10
مخزن Debian main all
نام بسته bio-tradis
نام فایل بسته bio-tradis_1.4.1+dfsg-1_all.deb
نسخه بسته 1.4.1+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/sanger-pathogens/Bio-Tradis
مجوز -
حجم دانلود 38808
حجم نصب 175
Bio-Tradis contains a set of tools to analyse the output from TraDIS analyses. . The Bio-Tradis analysis pipeline is implemented as an extensible Perl library which can either be used as is, or as a basis for the development of more advanced analysis tools. . Please note: You need to manually install BioConductor Edger which can not be distributed by Debian in recent version since it is using non-distributable code locfit.


نیازمندی

مقدار نام
- perl
- smalt
- samtools
- tabix
- r-base-core
- r-cran-getopt
- r-cran-mass


نحوه نصب


نصب پکیج deb bio-tradis:

    sudo apt-get install bio-tradis_1.4.1+dfsg-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/add_tradis_tags
./usr/bin/bacteria_tradis
./usr/bin/check_tradis_tags
./usr/bin/combine_tradis_plots
./usr/bin/filter_tradis_tags
./usr/bin/remove_tradis_tags
./usr/bin/tradis_comparison
./usr/bin/tradis_comparison.R
./usr/bin/tradis_essentiality
./usr/bin/tradis_essentiality.R
./usr/bin/tradis_gene_insert_sites
./usr/bin/tradis_merge_plots
./usr/bin/tradis_plot
./usr/share/doc/bio-tradis/README.Debian
./usr/share/doc/bio-tradis/README.md.gz
./usr/share/doc/bio-tradis/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/bio-tradis/copyright
./usr/share/man/man1/add_tradis_tags.1.gz
./usr/share/man/man1/bacteria_tradis.1.gz
./usr/share/man/man1/check_tradis_tags.1.gz
./usr/share/man/man1/combine_tradis_plots.1.gz
./usr/share/man/man1/filter_tradis_tags.1.gz
./usr/share/man/man1/remove_tradis_tags.1.gz
./usr/share/man/man1/tradis_comparison.1.gz
./usr/share/man/man1/tradis_essentiality.1.gz
./usr/share/man/man1/tradis_gene_insert_sites.1.gz
./usr/share/man/man1/tradis_merge_plots.1.gz
./usr/share/man/man1/tradis_plot.1.gz
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/AddTagsToSeq.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Analysis/Exceptions.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Analysis/InsertSite.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CombinePlots.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/AddTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/CheckTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/FilterFastqTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/PlotCombine.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/PlotTradis.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/RemoveFastqTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/RunMapping.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/TradisAnalysis.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/CommandLine/TradisBam.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/DetectTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Exception.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/FilterTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Map.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Parser/Bam.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Parser/Cigar.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Parser/Fastq.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/RemoveTags.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/RunTradis.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/Samtools.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis/TradisPlot.pm
./usr/share/perl5/Bio/Tradis.pm