معرفی شرکت ها

jellyfish_2.3.0-10_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

count k-mers in DNA sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته jellyfish
نام فایل بسته jellyfish_2.3.0-10_amd64.deb
نسخه بسته 2.3.0
انتشار بسته 10
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.cbcb.umd.edu/software/jellyfish/
مجوز -
حجم دانلود 789540
حجم نصب 2485
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism. . JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
jellyfish-examples_2.3.0-10_all.deb 2.3.0 all Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_amd64.deb 1.1.11 amd64 Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_arm64.deb 1.1.11 arm64 Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_armel.deb 1.1.11 armel Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_armhf.deb 1.1.11 armhf Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_i386.deb 1.1.11 i386 Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_mips64el.deb 1.1.11 mips64el Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_ppc64el.deb 1.1.11 ppc64el Debian main
jellyfish1_1.1.11-5_s390x.deb 1.1.11 s390x Debian main
jellyfish_2.3.0-10_arm64.deb 2.3.0 arm64 Debian main
jellyfish_2.3.0-10_armel.deb 2.3.0 armel Debian main
jellyfish_2.3.0-10_armhf.deb 2.3.0 armhf Debian main
jellyfish_2.3.0-10_i386.deb 2.3.0 i386 Debian main
jellyfish_2.3.0-10_mips64el.deb 2.3.0 mips64el Debian main
jellyfish_2.3.0-10_ppc64el.deb 2.3.0 ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 1.10 libhts3
= 2.3.0-10 libjellyfish-2.0-2
>= 9 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb jellyfish:

    sudo apt-get install jellyfish_2.3.0-10_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/jellyfish
./usr/lib/jellyfish/bin/fastq2sam
./usr/lib/jellyfish/bin/generate_sequence
./usr/lib/jellyfish/bin/test_all
./usr/share/doc/jellyfish/README.test
./usr/share/doc/jellyfish/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/jellyfish/changelog.gz
./usr/share/doc/jellyfish/copyright
./usr/share/doc/jellyfish/jellyfish.pdf.gz
./usr/share/doc/jellyfish/run-unit-test
./usr/share/doc-base/jellyfish
./usr/share/man/man1/jellyfish.1.gz