معرفی شرکت ها
fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_arm64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
tools for searching collections of biological sequences
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main arm64 |
| نام بسته | fasta3 |
| نام فایل بسته | fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_arm64.deb |
| نسخه بسته | 36.3.8h.2020 |
| انتشار بسته | 02 |
| معماری بسته | arm64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://fasta.bioch.virginia.edu |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 696464 |
| حجم نصب | 5505 |
The FASTA programs find regions of local or global similarity between
Protein or DNA sequences, either by searching Protein or DNA databases,
or by identifying local duplications within a sequence. Other
programs provide information on the statistical significance of an
alignment. Like BLAST, FASTA can be used to infer functional and
evolutionary relationships between sequences as well as help identify
members of gene families.
.
* Protein
- Protein-protein FASTA
- Protein-protein Smith-Waterman (ssearch)
- Global Protein-protein (Needleman-Wunsch) (ggsearch)
- Global/Local protein-protein (glsearch)
- Protein-protein with unordered peptides (fasts)
- Protein-protein with mixed peptide sequences (fastf)
.
* Nucleotide
- Nucleotide-Nucleotide (DNA/RNA fasta)
- Ordered Nucleotides vs Nucleotide (fastm)
- Un-ordered Nucleotides vs Nucleotide (fasts)
.
* Translated
- Translated DNA (with frameshifts, e.g. ESTs)
vs Proteins (fastx/fasty)
- Protein vs Translated DNA (with frameshifts)
(tfastx/tfasty)
- Peptides vs Translated DNA (tfasts)
.
* Statistical Significance
- Protein vs Protein shuffle (prss)
- DNA vs DNA shuffle (prss)
- Translated DNA vs Protein shuffle (prfx)
.
* Local Duplications
- Local Protein alignments (lalign)
- Plot Protein alignment "dot-plot" (plalign)
- Local DNA alignments (lalign)
- Plot DNA alignment "dot-plot" (plalign)
.
This software is often used via a web service at the
EBI with readily indexed reference databases at
http://www.ebi.ac.uk/Tools/fasta/.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| fasta3-doc_36.3.8h.2020-02-11-3_all.deb | 36.3.8h.2020 | all | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_amd64.deb | 36.3.8h.2020 | amd64 | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_armel.deb | 36.3.8h.2020 | armel | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_armhf.deb | 36.3.8h.2020 | armhf | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_i386.deb | 36.3.8h.2020 | i386 | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_mips64el.deb | 36.3.8h.2020 | mips64el | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_mipsel.deb | 36.3.8h.2020 | mipsel | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_ppc64el.deb | 36.3.8h.2020 | ppc64el | Debian main |
| fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_s390x.deb | 36.3.8h.2020 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.29 | libc6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb fasta3:
sudo apt-get install fasta3_36.3.8h.2020-02-11-3+b2_arm64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/fasta36 |
| ./usr/bin/fastf36 |
| ./usr/bin/fastm36 |
| ./usr/bin/fasts36 |
| ./usr/bin/fastx36 |
| ./usr/bin/fasty36 |
| ./usr/bin/ggsearch36 |
| ./usr/bin/glsearch36 |
| ./usr/bin/lalign36 |
| ./usr/bin/map_db |
| ./usr/bin/ssearch36 |
| ./usr/bin/tfastf36 |
| ./usr/bin/tfastm36 |
| ./usr/bin/tfasts36 |
| ./usr/bin/tfastx36 |
| ./usr/bin/tfasty36 |
| ./usr/share/doc/fasta3/changelog.Debian.arm64.gz |
| ./usr/share/doc/fasta3/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/fasta3/copyright |
| ./usr/share/doc/fasta3/examples/mgstm1.aa |
| ./usr/share/doc/fasta3/examples/prot_test.lseg |
| ./usr/share/fasta3/README |
| ./usr/share/fasta3/README.scripts |
| ./usr/share/fasta3/acc_examples |
| ./usr/share/fasta3/ann_exons_all.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_exons_ens.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_exons_ncbi.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_exons_up_sql.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_exons_up_sql_www.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_exons_up_www.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_feats2ipr.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_feats2ipr_e.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_feats_up_sql.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_feats_up_www2.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_ipr_www.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_pdb_cath.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_pdb_vast.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_pfam30_tmptbl.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_pfam_sql.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_pfam_www.pl |
| ./usr/share/fasta3/ann_script_list |
| ./usr/share/fasta3/ann_upfeats_pfam_www_e.pl |
| ./usr/share/fasta3/annot_blast_btop2.pl |
| ./usr/share/fasta3/annot_blast_btop3.py |
| ./usr/share/fasta3/annot_blast_btop4.py |
| ./usr/share/fasta3/blastp_annot_cmd.sh |
| ./usr/share/fasta3/blastp_cmd.sh |
| ./usr/share/fasta3/color_defs.pl |
| ./usr/share/fasta3/exp_up_ensg.pl |
| ./usr/share/fasta3/expand_links.pl |
| ... and 33 more |