معرفی شرکت ها

cat-bat_5.2.2-1_arm64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

taxonomic classification of contigs and metagenome-assembled genomes (MAGs)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main arm64
نام بسته cat-bat
نام فایل بسته cat-bat_5.2.2-1_arm64.deb
نسخه بسته 5.2.2
انتشار بسته 1
معماری بسته arm64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/dutilh/CAT
مجوز -
حجم دانلود 29468
حجم نصب 180
Contig Annotation Tool (CAT) and Bin Annotation Tool (BAT) are pipelines for the taxonomic classification of long DNA sequences and metagenome assembled genomes (MAGs/bins) of both known and (highly) unknown microorganisms, as generated by contemporary metagenomics studies. The core algorithm of both programs involves gene calling, mapping of predicted ORFs against the nr protein database, and voting-based classification of the entire contig / MAG based on classification of the individual ORFs. CAT and BAT can be run from intermediate steps if files are formatted appropriately.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
cat-bat_5.2.2-1_amd64.deb 5.2.2 amd64 Debian main
cat-bat_5.2.2-1_ppc64el.deb 5.2.2 ppc64el Debian main
cat-bat_5.2.2-1_s390x.deb 5.2.2 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- python3:any
- diamond-aligner
- prodigal


نحوه نصب


نصب پکیج deb cat-bat:

    sudo apt-get install cat-bat_5.2.2-1_arm64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/cat-bat/CAT
./usr/share/cat-bat/about.py
./usr/share/cat-bat/add_names.py
./usr/share/cat-bat/bins.py
./usr/share/cat-bat/check.py
./usr/share/cat-bat/contigs.py
./usr/share/cat-bat/prepare.py
./usr/share/cat-bat/shared.py
./usr/share/cat-bat/single_bin.py
./usr/share/cat-bat/summarise.py
./usr/share/cat-bat/tax.py
./usr/share/doc/cat-bat/README.md.gz
./usr/share/doc/cat-bat/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/cat-bat/changelog.gz
./usr/share/doc/cat-bat/copyright
./usr/share/man/man1/CAT.1.gz
./usr/share/python3/runtime.d/cat-bat.rtupdate
./usr/bin/CAT -> ../share/cat-bat/CAT