معرفی شرکت ها

srst2_0.2.0-8_mips64el.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main mips64el
نام بسته srst2
نام فایل بسته srst2_0.2.0-8_mips64el.deb
نسخه بسته 0.2.0
انتشار بسته 8
معماری بسته mips64el
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://katholt.github.io/srst2/
مجوز -
حجم دانلود 61128
حجم نصب 255
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
srst2_0.2.0-8_amd64.deb 0.2.0 amd64 Debian main
srst2_0.2.0-8_arm64.deb 0.2.0 arm64 Debian main
srst2_0.2.0-8_ppc64el.deb 0.2.0 ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- python3:any
- bowtie2
- cd-hit
- samtools
- python3-scipy
- python3-biopython


نحوه نصب


نصب پکیج deb srst2:

    sudo apt-get install srst2_0.2.0-8_mips64el.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/doc/srst2/README.html
./usr/share/doc/srst2/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/srst2/changelog.gz
./usr/share/doc/srst2/copyright
./usr/share/doc/srst2/example.txt.gz
./usr/share/doc/srst2/tests/test_slurm_srst2.py.gz
./usr/share/doc/srst2/tests/test_srst2.py.gz
./usr/share/doc-base/srst2
./usr/share/man/man1/VFDB_cdhit_to_csv.1.gz
./usr/share/man/man1/VFDBgenus.1.gz
./usr/share/man/man1/csv_to_gene_db.1.gz
./usr/share/man/man1/get_all_vfdb.1.gz
./usr/share/man/man1/get_genus_vfdb.1.gz
./usr/share/man/man1/getmlst.1.gz
./usr/share/man/man1/slurm_srst2.1.gz
./usr/share/man/man1/srst2.1.gz
./usr/share/python3/runtime.d/srst2.rtupdate
./usr/share/srst2/__init__.py
./usr/share/srst2/analyseSRST2.py
./usr/share/srst2/consensus_alignment.py
./usr/share/srst2/database_clustering/VFDB_cdhit_to_csv.py
./usr/share/srst2/database_clustering/VFDBgenus.py
./usr/share/srst2/database_clustering/align_plot_tree_min3.py
./usr/share/srst2/database_clustering/cdhit_to_csv.py
./usr/share/srst2/database_clustering/csv_to_gene_db.py
./usr/share/srst2/database_clustering/get_all_vfdb.sh
./usr/share/srst2/database_clustering/get_genus_vfdb.sh
./usr/share/srst2/getmlst.py
./usr/share/srst2/qsub_srst2.py
./usr/share/srst2/slurm_srst2.py
./usr/share/srst2/srst2.py
./usr/share/srst2/version.py
./usr/bin/VFDB_cdhit_to_csv -> ../share/srst2/database_clustering/VFDB_cdhit_to_csv.py
./usr/bin/VFDBgenus -> ../share/srst2/database_clustering/VFDBgenus.py
./usr/bin/csv_to_gene_db -> ../share/srst2/database_clustering/csv_to_gene_db.py
./usr/bin/get_all_vfdb -> ../share/srst2/database_clustering/get_all_vfdb.sh
./usr/bin/get_genus_vfdb -> ../share/srst2/database_clustering/get_genus_vfdb.sh
./usr/bin/getmlst -> ../share/srst2/getmlst.py
./usr/bin/slurm_srst2 -> ../share/srst2/slurm_srst2.py
./usr/bin/srst2 -> ../share/srst2/srst2.py