معرفی شرکت ها

ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_mips64el.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main mips64el
نام بسته ngmlr
نام فایل بسته ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_mips64el.deb
نسخه بسته 0.2.7+dfsg
انتشار بسته 4+b1
معماری بسته mips64el
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/philres/ngmlr
مجوز -
حجم دانلود 666976
حجم نصب 1210
Ngmlr is a long-read mapper designed to sensitively align PacBilo or Oxford Nanopore to (large) reference genomes. It was designed to quickly and correctly align the reads, including those spanning (complex) structural variations. Ngmlr uses an SV aware k-mer search to find approximate mapping locations for a read and then a banded Smith- Waterman alignment algorithm to compute the final alignment. Ngmlr uses a convex gap cost model that penalizes gap extensions for longer gaps less than for shorter ones to compute precise alignments.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_amd64.deb 0.2.7+dfsg amd64 Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_arm64.deb 0.2.7+dfsg arm64 Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_armel.deb 0.2.7+dfsg armel Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_armhf.deb 0.2.7+dfsg armhf Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_i386.deb 0.2.7+dfsg i386 Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_mipsel.deb 0.2.7+dfsg mipsel Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_ppc64el.deb 0.2.7+dfsg ppc64el Debian main
ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_s390x.deb 0.2.7+dfsg s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 1.1 libssw0
>= 9 libstdc++6
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb ngmlr:

    sudo apt-get install ngmlr_0.2.7+dfsg-4+b1_mips64el.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/ngmlr
./usr/share/doc/ngmlr/README.md.gz
./usr/share/doc/ngmlr/README.test
./usr/share/doc/ngmlr/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/ngmlr/changelog.Debian.mips64el.gz
./usr/share/doc/ngmlr/copyright
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_1/expected.txt
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_1/long_name.fa
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_1/ref_chr6_140kb.fa
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_2/expected.bed
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_2/reads_100_2200bp.fa
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_2/ref_chr21_20kb.fa
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_2/result.bed
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_3/read.fa.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_3/reference.fasta.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_4/expected.txt
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_4/read.fa.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_4/reference.fasta.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_5/read.fa.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_5/reference.fasta.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_6/read.fa.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/data/test_6/reference.fasta.gz
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_1.sh
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_2.sh
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_3.sh
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_4.sh
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_5.sh
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_6.sh
./usr/share/doc/ngmlr/examples/test_travis.sh
./usr/share/doc/ngmlr/run-unit-test
./usr/share/man/man1/ngmlr.1.gz