معرفی شرکت ها
python3-cyvcf2_0.30.4-4_i386.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
VCF parser based on htslib (Python 3)
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main i386 |
| نام بسته | python3-cyvcf2 |
| نام فایل بسته | python3-cyvcf2_0.30.4-4_i386.deb |
| نسخه بسته | 0.30.4 |
| انتشار بسته | 4 |
| معماری بسته | i386 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/brentp/cyvcf2 |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 806400 |
| حجم نصب | 4779 |
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries
with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide
variation with Python on high-throughput sequencing data.
.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like
variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are
immediately ready for downstream use.
.
This package installs the library for Python 3.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_amd64.deb | 0.30.4 | amd64 | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_arm64.deb | 0.30.4 | arm64 | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_armel.deb | 0.30.4 | armel | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_armhf.deb | 0.30.4 | armhf | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_mips64el.deb | 0.30.4 | mips64el | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_mipsel.deb | 0.30.4 | mipsel | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_ppc64el.deb | 0.30.4 | ppc64el | Debian main |
| python3-cyvcf2_0.30.4-4_s390x.deb | 0.30.4 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 1:1.16.0~rc1 | python3-numpy |
| - | python3-numpy-abi9 |
| << 3.10 | python3 |
| >= 3.9~ | python3 |
| - | python3-click |
| - | python3-coloredlogs |
| - | python3:any |
| >= 2.7 | libc6 |
| >= 1.10 | libhts3 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb python3-cyvcf2:
sudo apt-get install python3-cyvcf2_0.30.4-4_i386.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/cyvcf2 |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/__main__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cli.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.c |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.cpython-39-i386-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.pxd |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/cyvcf2.pyx |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/helpers.c |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/helpers.h |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/relatedness.h |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/bug.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/decomposed.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/empty.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/issue_44.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/no-seq-len.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/no-seq-names.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/o.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/seg.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-alt-repr.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-diff.csi |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-format-string.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-haploidX.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-hemi.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-invalid-header.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-multiallelic-homozygous-alt.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-multiallelic-homozygous-alt.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-strict-gt-option-flag.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test-strict-gt-option-flag.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.bug.117.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.comp_het.3.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.snpeff.bcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.snpeff.bcf.csi |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.snpeff.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_cli.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_gt_alt_freqs.vcf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_gt_bases.vcf.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_hemi.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_reader.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2/tests/test_writer.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.4.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.4.egg-info/dependency_links.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.4.egg-info/entry_points.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.4.egg-info/not-zip-safe |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.4.egg-info/requires.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/cyvcf2-0.30.4.egg-info/top_level.txt |
| ./usr/share/doc/python3-cyvcf2/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/python3-cyvcf2/copyright |
| ./usr/share/man/man1/cyvcf2.1.gz |