معرفی شرکت ها

physamp_1.1.0-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

sample sequence alignment corresponding to phylogeny
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته physamp
نام فایل بسته physamp_1.1.0-2_amd64.deb
نسخه بسته 1.1.0
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://jydu.github.io/physamp/
مجوز -
حجم دانلود 187280
حجم نصب 1778
The PhySamp package currently contains two programs: bppphysamp, which samples sequences according to their similarity, and bppalnoptim, which samples a sequence alignment by removing sequences in order to maximize the number of sites suitable for a given analysis. The bppalnoptim program has three running modes: * Interactive: the user will be iteratively proposed a set of choices for sequence removal, with their corresponding site gains. The procedure stops when the user does not want to remove more sequences, and the resulting filtered alignment is written. * Automatic: the user enters an a priori criterion for stopping the filtering procedure (for instance a minimum number of sequences to keep). * Diagnostic: this mode allows one to plot the trade-off curve, by showing the site gain as a function of the number of removed sequences.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
physamp_1.1.0-2_arm64.deb 1.1.0 arm64 Debian main
physamp_1.1.0-2_armel.deb 1.1.0 armel Debian main
physamp_1.1.0-2_armhf.deb 1.1.0 armhf Debian main
physamp_1.1.0-2_i386.deb 1.1.0 i386 Debian main
physamp_1.1.0-2_mips64el.deb 1.1.0 mips64el Debian main
physamp_1.1.0-2_mipsel.deb 1.1.0 mipsel Debian main
physamp_1.1.0-2_ppc64el.deb 1.1.0 ppc64el Debian main
physamp_1.1.0-2_s390x.deb 1.1.0 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.4.1 libbpp-core4
>= 2.4.1 libbpp-phyl12
>= 2.4.1 libbpp-seq12
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 9 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb physamp:

    sudo apt-get install physamp_1.1.0-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/bppalnoptim
./usr/bin/bppphysamp
./usr/share/doc/physamp/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/physamp/changelog.gz
./usr/share/doc/physamp/copyright
./usr/share/doc/physamp/examples/LSU/LSU.dnd
./usr/share/doc/physamp/examples/LSU/LSU.phy
./usr/share/doc/physamp/examples/LSU/PhySamp.bpp
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/AlnOptimAuto.bpp
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/AlnOptimFasttree.bpp
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/AlnOptimFasttreeStop.bpp
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/PF01049_fasttree.dnd
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/PF01049_full.txt
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/README
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/diagnostic.R
./usr/share/doc/physamp/examples/PF01049/runFasttree.sh
./usr/share/info/physamp.info.gz
./usr/share/man/man1/bppalnoptim.1.gz
./usr/share/man/man1/bppphysamp.1.gz