معرفی شرکت ها
vcfanno-examples_0.3.2+ds-2_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
examples for vcfanno: annotate a VCF with other VCFs/BEDs/tabixed files
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | vcfanno-examples |
| نام فایل بسته | vcfanno-examples_0.3.2+ds-2_all.deb |
| نسخه بسته | 0.3.2+ds |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/brentp/vcfanno |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 5752196 |
| حجم نصب | 5706 |
Vcfanno allows you to quickly annotate your VCF with any number of INFO
fields from any number of VCFs or BED files. It uses a simple conf file
to allow the user to specify the source annotation files and fields and
how they will be added to the info of the query VCF.
.
* For VCF, values are pulled by name from the INFO field with special
cases of ID and FILTER to pull from those VCF columns.
* For BED, values are pulled from (1-based) column number.
* For BAM, depth (count), "mapq" and "seq" are currently supported.
.
This package contains a test data set as well as sample scripts
running some test suite provided by Debian also as autopkgtest.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - |
نحوه نصب
نصب پکیج deb vcfanno-examples:
sudo apt-get install vcfanno-examples_0.3.2+ds-2_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/changelog.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/copyright |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/ex.sam.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/conf.toml |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/custom.lua |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/ex.bam.bai |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/ex.bam.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/exac.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/exac.vcf.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/fitcons.bed.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/fitcons.bed.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/gem.conf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/gnomad.conf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/query.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/rare-disease.conf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/example/rare-disease.lua |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/astar/astar.anno.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/astar/astar.anno.vcf.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/astar/astar.conf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/astar/astar.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/by_alt_float/annotation.tsv.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/by_alt_float/annotation.tsv.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/by_alt_float/conf.toml |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/by_alt_float/q.vcf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/at/conf.toml |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/at/test.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/at/testexon.bed.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/at/testexon.bed.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/conf.toml |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/dummyexons.bed.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/dummyexons.bed.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/citest/test.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/multiple-alts.conf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/multiple-alts.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/multiple-alts.vcf.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/number-input.vcf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/number.conf |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/number.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/data/number.vcf.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/dbnsfp/Calls_for_dbNSFP_example.vcf.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/dbnsfp/conf.toml |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/dbnsfp/dbNSFP_ex.txt.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/dbnsfp/dbNSFP_ex.txt.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/dbnsfp/dbNSFP_example.txt.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/dbnsfp/dbNSFP_example.txt.gz.tbi |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/find-out-of-order.py |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/functional-test.sh.gz |
| ./usr/share/doc/vcfanno-examples/tests/id-test/cosmic.small.vcf.gz |
| ... and 36 more |