معرفی شرکت ها
r-cran-alakazam_1.1.0-1_armel.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Immunoglobulin Clonal Lineage and Diversity Analysis
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main armel |
| نام بسته | r-cran-alakazam |
| نام فایل بسته | r-cran-alakazam_1.1.0-1_armel.deb |
| نسخه بسته | 1.1.0 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | armel |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://cran.r-project.org/package=alakazam |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 2540228 |
| حجم نصب | 2926 |
Alakazam is part of the Immcantation analysis framework for Adaptive
Immune Receptor Repertoire sequencing (AIRR-seq) and provides a set of
tools to investigate lymphocyte receptor clonal lineages, diversity,
gene usage, and other repertoire level properties, with a focus on
high-throughput immunoglobulin (Ig) sequencing.
.
Alakazam serves five main purposes:
* Providing core functionality for other R packages in the Immcantation
framework. This includes common tasks such as file I/O, basic DNA
sequence manipulation, and interacting with V(D)J segment and gene
annotations.
* Providing an R interface for interacting with the output of the
pRESTO and Change-O tool suites.
* Performing lineage reconstruction on clonal populations of Ig
sequences and analyzing the topology of the resultant lineage trees.
* Performing clonal abundance and diversity analysis on lymphocyte
repertoires.
* Performing physicochemical property analyses of lymphocyte receptor
sequences.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-cran-alakazam_1.1.0-1+b1_amd64.deb | 1.1.0 | amd64 | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_arm64.deb | 1.1.0 | arm64 | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_armhf.deb | 1.1.0 | armhf | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_i386.deb | 1.1.0 | i386 | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_mips64el.deb | 1.1.0 | mips64el | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_mipsel.deb | 1.1.0 | mipsel | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_ppc64el.deb | 1.1.0 | ppc64el | Debian main |
| r-cran-alakazam_1.1.0-1_s390x.deb | 1.1.0 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.0.4-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| >= 3.2.0 | r-cran-ggplot2 |
| - | r-cran-airr |
| - | r-cran-ape |
| - | r-bioc-biostrings |
| >= 1.0 | r-cran-dplyr |
| - | r-bioc-genomicalignments |
| >= 1.0.0 | r-cran-igraph |
| - | r-bioc-iranges |
| - | r-cran-lazyeval |
| - | r-cran-matrix |
| - | r-cran-progress |
| >= 0.12.12 | r-cran-rcpp |
| - | r-cran-readr |
| - | r-cran-rlang |
| - | r-cran-scales |
| - | r-cran-seqinr |
| - | r-cran-stringi |
| - | r-cran-tibble |
| >= 1.0.0 | r-cran-tidyr |
| >= 2.4 | libc6 |
| >= 3.5 | libgcc-s1 |
| >= 5.2 | libstdc++6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-cran-alakazam:
sudo apt-get install r-cran-alakazam_1.1.0-1_armel.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/NEWS.md |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/R/alakazam |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/R/alakazam.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/R/alakazam.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/R/sysdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/R/sysdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/data/Rdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/data/Rdata.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/data/Rdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/AminoAcids-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/AminoAcids-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/AminoAcids-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Diversity-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Diversity-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Diversity-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Fastq-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Fastq-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Fastq-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Files-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Files-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Files-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/GeneUsage-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/GeneUsage-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/GeneUsage-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Lineage-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Lineage-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Lineage-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Topology-Vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Topology-Vignette.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/Topology-Vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/extdata/example_airr.tsv.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/extdata/example_changeo.tab.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/extdata/example_quality.fastq |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/extdata/example_quality.tsv |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/help/alakazam.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/help/alakazam.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/alakazam/libs/alakazam.so |
| ./usr/share/doc/r-cran-alakazam/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-cran-alakazam/copyright |