معرفی شرکت ها

r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_arm64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BioConductor annotation of genetic variants
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main arm64
نام بسته r-bioc-variantannotation
نام فایل بسته r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_arm64.deb
نسخه بسته 1.36.0
انتشار بسته 1
معماری بسته arm64
نگهدارنده Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/VariantAnnotation/
مجوز -
حجم دانلود 3480932
حجم نصب 4787
This BioConductor package provides R functions to annotate variants, compute amino acid coding changess and to predict coding outcomes.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_amd64.deb 1.36.0 amd64 Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_armel.deb 1.36.0 armel Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_armhf.deb 1.36.0 armhf Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_i386.deb 1.36.0 i386 Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_mips64el.deb 1.36.0 mips64el Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_mipsel.deb 1.36.0 mipsel Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_ppc64el.deb 1.36.0 ppc64el Debian main
r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_s390x.deb 1.36.0 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 4.0.3-1 r-base-core
- r-api-4.0
- r-api-bioc-3.12
>= 0.15.3 r-bioc-biocgenerics
- r-bioc-matrixgenerics
>= 1.15.2 r-bioc-genomeinfodb
>= 1.41.5 r-bioc-genomicranges
>= 1.19.5 r-bioc-summarizedexperiment
>= 1.99.0 r-bioc-rsamtools
- r-cran-dbi
- r-bioc-zlibbioc
- r-bioc-biobase
>= 0.27.12 r-bioc-s4vectors
>= 2.23.9 r-bioc-iranges
>= 0.29.2 r-bioc-xvector
>= 2.57.2 r-bioc-biostrings
>= 1.27.9 r-bioc-annotationdbi
>= 1.39.7 r-bioc-rtracklayer
>= 1.47.3 r-bioc-bsgenome
>= 1.31.3 r-bioc-genomicfeatures
- r-bioc-rhtslib
>= 2.17 libc6
>= 7.18.0 libcurl4


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-variantannotation:

    sudo apt-get install r-bioc-variantannotation_1.36.0-1_arm64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/CITATION
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/INDEX
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/NEWS
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/R/VariantAnnotation
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/R/VariantAnnotation.rdb
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/R/VariantAnnotation.rdx
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/VariantAnnotation.R
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/VariantAnnotation.Rnw
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/VariantAnnotation.pdf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/filterVcf.R
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/filterVcf.Rnw
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/filterVcf.pdf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr22.vcf.gz
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr22.vcf.gz.tbi
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr7-sub.vcf.gz
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr7-sub.vcf.gz.tbi
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/ex2.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/gl_chr1.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/h1187-10k.vcf.gz
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/h1187-10k.vcf.gz.tbi
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/hapmap_exome_chr22.vcf.gz
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/hapmap_exome_chr22.vcf.gz.tbi
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/structural.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/VariantAnnotation.rdb
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/VariantAnnotation.rdx
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/html/R.css
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/libs/VariantAnnotation.so
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/scripts/test_Rplinkseq.R
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/FORMAT_header_no_SAMPLEs.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/VarScan_header.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/banded_gvcf.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/buffer_realloc.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/ex1-seq1-90.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/expand.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/fewer-FORMAT-than-GENO.vcf
./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/meta_header.vcf
... and 26 more