معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

دانلود نسخه باینری

توضیحات

tool to screen Klebsiella genome assemblies

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	Linux
توزیع	Debian Bullseye-11
مخزن	Debian main arm64
نام بسته	kleborate
نام فایل بسته	kleborate_2.0.1-1_arm64.deb
نسخه بسته	2.0.1
انتشار بسته	1
معماری بسته	arm64
نگهدارنده	Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت	-
هاست سازنده	-
نوع بسته	.deb
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/katholt/Kleborate
مجوز	-
حجم دانلود	5089804
حجم نصب	36700

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for: . * MLST sequence type * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.) * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt), colibactin (clb) * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2) * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs and colistin resistance truncations * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles and Kaptive

جایگزین ها

بسته	نسخه	معماری	مخزن
kleborate-examples_2.0.1-1_all.deb	2.0.1	all	Debian main
kleborate_2.0.1-1_amd64.deb	2.0.1	amd64	Debian main
kleborate_2.0.1-1_mips64el.deb	2.0.1	mips64el	Debian main
kleborate_2.0.1-1_ppc64el.deb	2.0.1	ppc64el	Debian main
kleborate_2.0.1-1_s390x.deb	2.0.1	s390x	Debian main

نیازمندی

مقدار	نام
-	python3-biopython
-	python3:any
-	ncbi-blast+
-	mash
-	kaptive
-	kaptive-data
-	python3-distutils

نحوه نصب

نصب پکیج deb kleborate:

sudo apt-get install kleborate_2.0.1-1_arm64.deb

فایل ها

مسیرها
./usr/bin/kleborate
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.0.1.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.0.1.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.0.1.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.0.1.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.0.1.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/Kleborate-2.0.1.egg-info/top_level.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/__main__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/blastn.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/contig_stats.py
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/AbST_profiles.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_AMR_clustered.csv
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta.ndb
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta.nhr
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta.not
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta.nsq
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta.ntf
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CARD_v3.0.8.fasta.nto
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/CbST_profiles.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp1.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp10.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp11.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp12.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp13.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp14.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp2.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp3.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp4.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp5.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp6.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp7.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp8.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/ICEKp_references/ICEKp9.embl
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.ndb
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.nhr
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.not
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.nsq
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.ntf
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/Klebsiella_pneumoniae.fasta.nto
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.ndb
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.nhr
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.not
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.nsq
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.ntf
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/MgrB_and_PmrB.fasta.nto
./usr/lib/python3/dist-packages/kleborate/data/OmpK.fasta
... and 83 more