معرفی شرکت ها

gmap_2021-02-22+ds-1_arm64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main arm64
نام بسته gmap
نام فایل بسته gmap_2021-02-22+ds-1_arm64.deb
نسخه بسته 2021
انتشار بسته 02
معماری بسته arm64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://research-pub.gene.com/gmap
مجوز -
حجم دانلود 7144068
حجم نصب 57915
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of * known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs). GSNAP can align bisulfite-treated DNA.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
gmap_2021-02-22+ds-1_amd64.deb 2021 amd64 Debian main
gmap_2021-02-22+ds-1_armel.deb 2021 armel Debian main
gmap_2021-02-22+ds-1_armhf.deb 2021 armhf Debian main
gmap_2021-02-22+ds-1_i386.deb 2021 i386 Debian main
gmap_2021-02-22+ds-1_mips64el.deb 2021 mips64el Debian main
gmap_2021-02-22+ds-1_mipsel.deb 2021 mipsel Debian main
gmap_2021-02-22+ds-1_ppc64el.deb 2021 ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
- perl:any
- libbz2-1.0
>= 2.29 libc6
>= 1:1.2.6 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb gmap:

    sudo apt-get install gmap_2021-02-22+ds-1_arm64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/gmap/atoiindex
./usr/lib/gmap/cmetindex
./usr/lib/gmap/cpuid
./usr/lib/gmap/dbsnp_iit
./usr/lib/gmap/ensembl_genes
./usr/lib/gmap/fa_coords
./usr/lib/gmap/get-genome
./usr/lib/gmap/gff3_genes
./usr/lib/gmap/gff3_introns
./usr/lib/gmap/gff3_splicesites
./usr/lib/gmap/gmap
./usr/lib/gmap/gmap.nosimd
./usr/lib/gmap/gmap_build
./usr/lib/gmap/gmap_cat
./usr/lib/gmap/gmap_process
./usr/lib/gmap/gmapindex
./usr/lib/gmap/gmapl
./usr/lib/gmap/gmapl.nosimd
./usr/lib/gmap/gsnap
./usr/lib/gmap/gsnap.nosimd
./usr/lib/gmap/gsnapl
./usr/lib/gmap/gsnapl.nosimd
./usr/lib/gmap/gtf_genes
./usr/lib/gmap/gtf_introns
./usr/lib/gmap/gtf_splicesites
./usr/lib/gmap/gtf_transcript_splicesites
./usr/lib/gmap/gvf_iit
./usr/lib/gmap/iit_dump
./usr/lib/gmap/iit_get
./usr/lib/gmap/iit_store
./usr/lib/gmap/indexdb_cat
./usr/lib/gmap/md_coords
./usr/lib/gmap/psl_genes
./usr/lib/gmap/psl_introns
./usr/lib/gmap/psl_splicesites
./usr/lib/gmap/sam_sort
./usr/lib/gmap/snpindex
./usr/lib/gmap/trindex
./usr/lib/gmap/vcf_iit
./usr/share/doc/gmap/NOTICE
./usr/share/doc/gmap/README.Debian
./usr/share/doc/gmap/README.gz
./usr/share/doc/gmap/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/gmap/changelog.gz
./usr/share/doc/gmap/copyright
./usr/share/doc/gmap/examples/tests.tar.xz
./usr/share/lintian/overrides/gmap
./usr/share/man/man1/gmap.1.gz
./usr/share/man/man1/gmap_build.1.gz
./usr/share/man/man1/gsnap.1.gz
./usr/bin/gmap -> ../lib/gmap/gmap
./usr/bin/gmap.nosimd -> ../lib/gmap/gmap.nosimd
./usr/bin/gmap_build -> ../lib/gmap/gmap_build
./usr/bin/gmapl -> ../lib/gmap/gmapl
./usr/bin/gmapl.nosimd -> ../lib/gmap/gmapl.nosimd
./usr/bin/gsnap -> ../lib/gmap/gsnap
./usr/bin/gsnap.nosimd -> ../lib/gmap/gsnap.nosimd
./usr/bin/gsnapl -> ../lib/gmap/gsnapl
./usr/bin/gsnapl.nosimd -> ../lib/gmap/gsnapl.nosimd