معرفی شرکت ها
chip-seq_1.5.5-3_arm64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
tools performing common ChIP-Seq data analysis tasks
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main arm64 |
| نام بسته | chip-seq |
| نام فایل بسته | chip-seq_1.5.5-3_arm64.deb |
| نسخه بسته | 1.5.5 |
| انتشار بسته | 3 |
| معماری بسته | arm64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://ccg.epfl.ch//chipseq |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 99828 |
| حجم نصب | 456 |
The ChIP-Seq software provides a set of tools performing common genome-
wide ChIP- seq analysis tasks, including positional correlation
analysis, peak detection, and genome partitioning into signal-rich and
signal-poor regions. These tools exist as stand-alone C programs and
perform the following tasks:
.
1. Positional correlation analysis and generation of an aggregation
plot (AP) (chipcor),
2. Extraction of specific genome annotation features around reference
anchor points (chipextract),
3. Read centering or shifting (chipcenter),
4. Narrow peak caller using a fixed width peak size (chippeak),
5. Broad peak caller used for large regions of enrichment (chippart),
6. Feature selection tool based on a read count threshold (chipscore).
.
Because the ChIP-Seq tools are primarily optimized for speed, they use
their own compact format for ChIP-seq data representation called SGA
(Simplified Genome Annotation). SGA is a line-oriented, tab-delimited
plain text format.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| chip-seq-data_1.5.5-3_all.deb | 1.5.5 | all | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_amd64.deb | 1.5.5 | amd64 | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_armel.deb | 1.5.5 | armel | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_armhf.deb | 1.5.5 | armhf | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_i386.deb | 1.5.5 | i386 | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_mips64el.deb | 1.5.5 | mips64el | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_mipsel.deb | 1.5.5 | mipsel | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_ppc64el.deb | 1.5.5 | ppc64el | Debian main |
| chip-seq_1.5.5-3_s390x.deb | 1.5.5 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.17 | libc6 |
| - | chip-seq-data |
| - | libmath-round-perl |
نحوه نصب
نصب پکیج deb chip-seq:
sudo apt-get install chip-seq_1.5.5-3_arm64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/bed2bed_display |
| ./usr/bin/bed2sga |
| ./usr/bin/check_bed.pl |
| ./usr/bin/chipcenter |
| ./usr/bin/chipcor |
| ./usr/bin/chipextract |
| ./usr/bin/chippart |
| ./usr/bin/chippeak |
| ./usr/bin/chipscore |
| ./usr/bin/chr_replace_sga.pl |
| ./usr/bin/compactsga |
| ./usr/bin/countsga |
| ./usr/bin/eland2sga.pl |
| ./usr/bin/featreplace |
| ./usr/bin/filter_counts |
| ./usr/bin/fps2sga.pl |
| ./usr/bin/gff2sga.pl |
| ./usr/bin/partit2bed.pl |
| ./usr/bin/partit2gff.pl |
| ./usr/bin/sga2bed |
| ./usr/bin/sga2fps.pl |
| ./usr/bin/sga2gff.pl |
| ./usr/bin/sga2wig |
| ./usr/share/doc/chip-seq/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/chip-seq/copyright |
| ./usr/share/doc/chip-seq/examples/H3K4me3.sga |
| ./usr/share/lintian/overrides/chip-seq |
| ./usr/share/man/man1/bed2bed_display.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/bed2sga.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/chipcenter.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/chipcor.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/chipextract.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/chippart.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/chippeak.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/chipscore.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/compactsga.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/countsga.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/featreplace.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/filter_counts.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/fps2sga.pl.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/gff2sga.pl.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/partit2bed.pl.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/sga2bed.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/sga2fps.pl.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/sga2gff.pl.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/sga2wig.1.gz |