معرفی شرکت ها
unicycler_0.4.8+dfsg-2_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main amd64 |
| نام بسته | unicycler |
| نام فایل بسته | unicycler_0.4.8+dfsg-2_amd64.deb |
| نسخه بسته | 0.4.8+dfsg |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/rrwick/Unicycler |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 881684 |
| حجم نصب | 3532 |
Unicycler is an assembly pipeline for bacterial genomes. It can assemble
Illumina-only read sets where it functions as a SPAdes-optimiser. It can
also assembly long-read-only sets (PacBio or Nanopore) where it runs a
miniasm+Racon pipeline. For the best possible assemblies, give it both
Illumina reads and long reads, and it will conduct a hybrid assembly.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| unicycler-data_0.4.8+dfsg-2_all.deb | 0.4.8+dfsg | all | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3~ | python3 |
| - | python3:any |
| >= 2.29 | libc6 |
| >= 1:3.0 | libgcc1 |
| >= 6 | libstdc++6 |
| >= 1:1.1.4 | zlib1g |
| - | python3-setuptools |
| - | default-jre |
| - | bcftools |
| - | bowtie2 |
| - | miniasm |
| - | ncbi-blast+ |
| - | pilon |
| - | racon |
| - | samtools |
| >= 3.13.1 | spades |
نحوه نصب
نصب پکیج deb unicycler:
sudo apt-get install unicycler_0.4.8+dfsg-2_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/unicycler |
| ./usr/bin/unicycler_align |
| ./usr/bin/unicycler_check |
| ./usr/bin/unicycler_polish |
| ./usr/bin/unicycler_scrub |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/alignment.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/assembly_graph.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/assembly_graph_copy_depth.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/assembly_graph_segment.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/blast_func.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/bridge_common.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/bridge_long_read.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/bridge_long_read_simple.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/bridge_loop_unroll.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/bridge_miniasm.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/bridge_spades_contig.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/cpp_functions.so |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/cpp_wrappers.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/gene_data/lambda_phage.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/gene_data/start_genes.fasta |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/log.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/miniasm_assembly.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/minimap_alignment.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/misc.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/path_finding.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/pilon_func.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/read_ref.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/settings.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/spades_func.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/string_graph.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/unicycler.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/unicycler_align.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/unicycler_check.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/unicycler_polish.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/unicycler_scrub.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/vcf_func.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler/version.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler-0.4.8.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler-0.4.8.egg-info/dependency_links.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler-0.4.8.egg-info/entry_points.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler-0.4.8.egg-info/not-zip-safe |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/unicycler-0.4.8.egg-info/top_level.txt |
| ./usr/share/doc/unicycler/README.test |
| ./usr/share/doc/unicycler/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/unicycler/copyright |
| ./usr/share/doc/unicycler/run-unit-test |
| ./usr/share/man/man1/unicycler.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/unicycler_align.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/unicycler_check.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/unicycler_polish.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/unicycler_scrub.1.gz |