معرفی شرکت ها
simkamin_1.5.3-4_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
approximate comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian main all |
| نام بسته | simkamin |
| نام فایل بسته | simkamin_1.5.3-4_all.deb |
| نسخه بسته | 1.5.3 |
| انتشار بسته | 4 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/GATB/simka |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 32040 |
| حجم نصب | 385 |
Simka is a de novo comparative metagenomics tool. Simka represents each
dataset as a k-mer spectrum and compute several classical ecological
distances between them.
.
The difference with Simka stands in the fact that SimkaMin outputs
approximate (but very similar) results by subsampling the kmer space.
With this strategy, and with default parameters, SimkaMin is an order
of magnitude faster, uses 10 times less memory and 70 times less disk
than Simka.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3:any |
| - | python3 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb simkamin:
sudo apt-get install simkamin_1.5.3-4_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/simkamin/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/simkamin/copyright |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/test_simkaMin.py.gz |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-1000_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-1000_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-1000_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-1000_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-100_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-100_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-100_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__0-100_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-1000_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-1000_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-1000_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-1000_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-100_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-100_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-100_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21__100-100_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-1000_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-1000_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-1000_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-1000_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-100_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-100_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-100_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_0-100_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-1000_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-1000_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-1000_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-1000_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-100_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-100_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-100_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k21_filter_100-100_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-1000_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-1000_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-1000_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-1000_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-100_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-100_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-100_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__0-100_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-1000_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-1000_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-1000_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-1000_n1/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-100_n0/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-100_n0/mat_presenceAbsence_jaccard.csv |
| ./usr/share/doc/simkamin/example/simkaMin/truth_simkaMin/k31__100-100_n1/mat_abundance_braycurtis.csv |
| ... and 184 more |