معرفی شرکت ها

rna-star_2.7.8a+dfsg-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

ultrafast universal RNA-seq aligner
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته rna-star
نام فایل بسته rna-star_2.7.8a+dfsg-2_amd64.deb
نسخه بسته 2.7.8a+dfsg
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/alexdobin/STAR/
مجوز -
حجم دانلود 1278592
حجم نصب 21606
Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR) software based on a previously undescribed RNA-seq alignment algorithm that uses sequential maximum mappable seed search in uncompressed suffix arrays followed by seed clustering and stitching procedure. STAR outperforms other aligners by a factor of >50 in mapping speed, aligning to the human genome 550 million 2 × 76 bp paired-end reads per hour on a modest 12-core server, while at the same time improving alignment sensitivity and precision. In addition to unbiased de novo detection of canonical junctions, STAR can discover non-canonical splices and chimeric (fusion) transcripts, and is also capable of mapping full-length RNA sequences. Using Roche 454 sequencing of reverse transcription polymerase chain reaction amplicons, the authors experimentally validated 1960 novel intergenic splice junctions with an 80-90% success rate, corroborating the high precision of the STAR mapping strategy.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
rna-star_2.7.8a+dfsg-2_arm64.deb 2.7.8a+dfsg arm64 Debian main
rna-star_2.7.8a+dfsg-2_mips64el.deb 2.7.8a+dfsg mips64el Debian main
rna-star_2.7.8a+dfsg-2_ppc64el.deb 2.7.8a+dfsg ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.3.1 libgcc-s1
>= 1.10 libhts3
>= 9 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb rna-star:

    sudo apt-get install rna-star_2.7.8a+dfsg-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/rna-star/bin/STAR-avx
./usr/lib/rna-star/bin/STAR-avx2
./usr/lib/rna-star/bin/STAR-plain
./usr/lib/rna-star/bin/STAR-sse3
./usr/lib/rna-star/bin/STAR-sse4.1
./usr/lib/rna-star/bin/STAR-ssse3
./usr/lib/rna-star/bin/STARlong-avx
./usr/lib/rna-star/bin/STARlong-avx2
./usr/lib/rna-star/bin/STARlong-plain
./usr/lib/rna-star/bin/STARlong-sse3
./usr/lib/rna-star/bin/STARlong-sse4.1
./usr/lib/rna-star/bin/STARlong-ssse3
./usr/lib/rna-star/simd-dispatch
./usr/share/doc/rna-star/README.Debian
./usr/share/doc/rna-star/README.md
./usr/share/doc/rna-star/RELEASEnotes.md.gz
./usr/share/doc/rna-star/STARmanual.pdf
./usr/share/doc/rna-star/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/rna-star/changelog.gz
./usr/share/doc/rna-star/copyright
./usr/share/doc-base/rna-star
./usr/share/man/man1/STAR.1.gz
./usr/bin/STAR -> ../lib/rna-star/simd-dispatch
./usr/bin/STARlong -> ../lib/rna-star/simd-dispatch