معرفی شرکت ها

pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Preparation of protein structures for electrostatics calculations
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته pdb2pqr
نام فایل بسته pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_amd64.deb
نسخه بسته 2.1.1+dfsg
انتشار بسته 7+deb11u1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/apbs/pdb2pqr.html
مجوز -
حجم دانلود 392224
حجم نصب 2934
PDB2PQR is a Python software package that automates many of the common tasks of preparing structures for continuum electrostatics calculations. It thus provides a platform-independent utility for converting protein files in PDB format to PQR format. These tasks include: * Adding a limited number of missing heavy atoms to biomolecular structures * Determining side-chain pKas * Placing missing hydrogens * Optimizing the protein for favorable hydrogen bonding * Assigning charge and radius parameters from a variety of force fields . This package also includes PropKa, a tool to modify the protonation state of protein structures in the Protein Data Bank (PDB) format to match a given pKa value. It can also be used to refine NMR structures, which often yield inaccurate pKa values for some residues.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
pdb2pqr-doc_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_all.deb 2.1.1+dfsg all Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_arm64.deb 2.1.1+dfsg arm64 Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_armel.deb 2.1.1+dfsg armel Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_armhf.deb 2.1.1+dfsg armhf Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_i386.deb 2.1.1+dfsg i386 Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_mips64el.deb 2.1.1+dfsg mips64el Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_mipsel.deb 2.1.1+dfsg mipsel Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_ppc64el.deb 2.1.1+dfsg ppc64el Debian main
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_s390x.deb 2.1.1+dfsg s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 5.2 libstdc++6
<< 3.10 python3
>= 3.9~ python3
- python3:any
- python3-numpy
- python3-networkx


نحوه نصب


نصب پکیج deb pdb2pqr:

    sudo apt-get install pdb2pqr_2.1.1+dfsg-7+deb11u1_amd64.deb