معرفی شرکت ها

mosdepth_0.3.1+ds-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BAM/CRAM depth calculation biological sequencing
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته mosdepth
نام فایل بسته mosdepth_0.3.1+ds-2_amd64.deb
نسخه بسته 0.3.1+ds
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/brentp/mosdepth
مجوز -
حجم دانلود 156120
حجم نصب 564
Many small reads are produced by high-throughput "next generation" sequencing technologies. The final sequence is derived from how these reads are overlapping towards a consensus. The more reads are covering/confirming parts of a nucleotide seq, the higher the confidence is. Too many reads would be indicative of e.g. repeats in the genome. . mosdepth can output: * per-base depth about 2x as fast samtools depth--about 25 minutes of CPU time for a 30X genome. * mean per-window depth given a window size--as would be used for CNV calling. * the mean per-region given a BED file of regions. * a distribution of proportion of bases covered at or above a given threshold for each chromosome and genome-wide. * quantized output that merges adjacent bases as long as they fall in the same coverage bins e.g. (10-20) * threshold output to indicate how many bases in each region are covered at the given thresholds. when appropriate, the output files are bgzipped and indexed for ease of use.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
mosdepth-examples_0.3.1+ds-2_all.deb 0.3.1+ds all Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_arm64.deb 0.3.1+ds arm64 Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_armel.deb 0.3.1+ds armel Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_armhf.deb 0.3.1+ds armhf Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_i386.deb 0.3.1+ds i386 Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_mips64el.deb 0.3.1+ds mips64el Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_mipsel.deb 0.3.1+ds mipsel Debian main
mosdepth_0.3.1+ds-2_ppc64el.deb 0.3.1+ds ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6


نحوه نصب


نصب پکیج deb mosdepth:

    sudo apt-get install mosdepth_0.3.1+ds-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/mosdepth
./usr/share/doc/mosdepth/TODO.Debian
./usr/share/doc/mosdepth/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/mosdepth/changelog.gz
./usr/share/doc/mosdepth/copyright
./usr/share/man/man1/mosdepth.1.gz