معرفی شرکت ها

biobambam2_2.0.179+ds-1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

tools for early stage alignment file processing
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته biobambam2
نام فایل بسته biobambam2_2.0.179+ds-1_amd64.deb
نسخه بسته 2.0.179+ds
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://gitlab.com/german.tischler/biobambam2
مجوز -
حجم دانلود 9422340
حجم نصب 65075
This package contains some tools for processing BAM files, including . bamsormadup: parallel sorting and duplicate marking bamcollate2: reads BAM and writes BAM reordered such that alignment or collated by query name bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments marked using the BAM flags field bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits from the flags column bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression setting. This tool is capable of multi-threading. bamsort: reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or query name bamtofastq: reads BAM and writes FastQ; output can be collated or uncollated by query name


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
biobambam2_2.0.179+ds-1_arm64.deb 2.0.179+ds arm64 Debian main
biobambam2_2.0.179+ds-1_i386.deb 2.0.179+ds i386 Debian main
biobambam2_2.0.179+ds-1_ppc64el.deb 2.0.179+ds ppc64el Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.4 libgcc-s1
>= 6 libgomp1
>= 2.0.768+dfsg libmaus2-2
>= 9 libstdc++6
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb biobambam2:

    sudo apt-get install biobambam2_2.0.179+ds-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/bam12auxmerge
./usr/bin/bam12split
./usr/bin/bam12strip
./usr/bin/bamadapterclip
./usr/bin/bamadapterfind
./usr/bin/bamalignfrac
./usr/bin/bamauxmerge
./usr/bin/bamauxmerge2
./usr/bin/bamauxsort
./usr/bin/bamcat
./usr/bin/bamchecksort
./usr/bin/bamclipXT
./usr/bin/bamclipreinsert
./usr/bin/bamcollate2
./usr/bin/bamdepth
./usr/bin/bamdepthintersect
./usr/bin/bamdifference
./usr/bin/bamdownsamplerandom
./usr/bin/bamexplode
./usr/bin/bamexploderef
./usr/bin/bamfastcat
./usr/bin/bamfastexploderef
./usr/bin/bamfastnumextract
./usr/bin/bamfastsplit
./usr/bin/bamfeaturecount
./usr/bin/bamfillquery
./usr/bin/bamfilteraux
./usr/bin/bamfiltereofblocks
./usr/bin/bamfilterflags
./usr/bin/bamfilterheader
./usr/bin/bamfilterheader2
./usr/bin/bamfilterk
./usr/bin/bamfilterlength
./usr/bin/bamfiltermc
./usr/bin/bamfilternames
./usr/bin/bamfilterrefid
./usr/bin/bamfilterrg
./usr/bin/bamfixmateinformation
./usr/bin/bamfixpairinfo
./usr/bin/bamflagsplit
./usr/bin/bamindex
./usr/bin/bamintervalcomment
./usr/bin/bamintervalcommenthist
./usr/bin/bammapdist
./usr/bin/bammarkduplicates
./usr/bin/bammarkduplicates2
./usr/bin/bammarkduplicatesopt
./usr/bin/bammaskflags
./usr/bin/bammdnm
./usr/bin/bammerge
... and 92 more