معرفی شرکت ها

ragout-examples_2.3-2_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Reference-Assisted Genome Ordering UTility (example data)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main all
نام بسته ragout-examples
نام فایل بسته ragout-examples_2.3-2_all.deb
نسخه بسته 2.3
انتشار بسته 2
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/fenderglass/Ragout/
مجوز -
حجم دانلود 18434144
حجم نصب 18023
Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) is a tool for chromosome-level scaffolding using multiple references. Given initial assembly fragments (contigs/scaffolds) and one or multiple related references (complete or draft), it produces a chromosome-scale assembly (as a set of scaffolds). . The approach is based on the analysis of genome rearrangements (like inversions or chromosomal translocations) between the input genomes and reconstructing the most parsimonious structure of the target genome. . Ragout now supports both small and large genomes (of mammalian scale and complexity). The assembly of highly polymorphic genomes is currently limited. . This package contains example data to test ragout.


نیازمندی

مقدار نام
-


نحوه نصب


نصب پکیج deb ragout-examples:

    sudo apt-get install ragout-examples_2.3-2_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/doc/ragout/examples/E.Coli/ecoli.rcp
./usr/share/doc/ragout/examples/E.Coli/mg1655.coords.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/E.Coli/mg1655_contigs.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/E.Coli/references/DH1.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/E.Coli/references/MG1655-K12.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/SJM180.coords.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/SJM180_contigs.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/helicobacter.rcp
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/references/ELS37.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/references/G27.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/references/Gambia94_24.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/references/Puno120.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/H.Pylori/references/SJM180.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/aureus.rcp
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/references/COL.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/references/JKD6008.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/references/N315.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/references/RF122.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/references/USA300_FPR3757.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/usa300.coords.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/S.Aureus/usa300_contigs.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/cholerae.rcp
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/h1.coords.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/h1_contigs.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/references/H1.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/references/O1_Inaba.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/references/O1_biovar.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout/examples/V.Cholerae/references/O395.fasta.gz
./usr/share/doc/ragout-examples/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/ragout-examples/copyright