معرفی شرکت ها

python3-pbcore_1.7.1+git20200430.a127b1e+dfsg-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Python 3 library for processing PacBio data files
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main all
نام بسته python3-pbcore
نام فایل بسته python3-pbcore_1.7.1+git20200430.a127b1e+dfsg-1_all.deb
نسخه بسته 1.7.1+git20200430.a127b1e+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/PacificBiosciences/pbcore
مجوز -
حجم دانلود 2880552
حجم نصب 4597
The pbcore package provides Python modules for processing Pacific Biosciences data files and building PacBio bioinformatics applications. These modules include tools to read/write PacBio data formats, sample data files for testing and debugging, base classes, and utilities for building bioinformatics applications. . This package is part of the SMRTAnalysis suite. . This is the Python 3 module.


نیازمندی

مقدار نام
>= 1.74 python3-biopython
- python3-numpy
>= 0.13 python3-pysam
- python3:any
- python3-pkg-resources


نحوه نصب


نصب پکیج deb python3-pbcore:

    sudo apt-get install python3-pbcore_1.7.1+git20200430.a127b1e+dfsg-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/pbopen
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/chemistry/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/chemistry/chemistry.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/chemistry/resources/mapping.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/Fluidigm_human_amplicons.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/Fluidigm_human_amplicons.fasta.fai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/Fluidigm_human_amplicons_tiny.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/barcodes-ed65-450.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/barcodes-ed65-450.fasta.fai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/blasr-output.m4
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/blasr-output.m5
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/chemistry.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/CollectionMetadata.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/alignment.dataset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/barcode.dataset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/ccsaligned.dataset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/ccsread.dataset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/contig.dataset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/empty_lambda.aligned.bam
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/empty_lambda.aligned.bam.bai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/empty_lambda.aligned.bam.pbi
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/fofn.fofn
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/lambda.alignmentset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/lambda.referenceset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/m140905_042212_sidney_c100564852550000001823085912221377_s1_X0.subreads.fake_bc.bam
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/m140905_042212_sidney_c100564852550000001823085912221377_s1_X0.subreads.fake_bc.bam.bai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/m140905_042212_sidney_c100564852550000001823085912221377_s1_X0.subreads.fake_bc.bam.pbi
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/m150430_142051_Mon_p1_b25.sts.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/m150616_053259_ethan_c100710482550000001823136404221563_s1_p0.sts.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim.alignmentset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.alignmentset.chunk0contigs.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.alignmentset.chunk1contigs.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.alignmentset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.pbalign.bam
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.pbalign.bam.bai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.pbalign.bam.pbi
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.reference.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.reference.fasta.fai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.referenceset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.subreads.bam
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.subreads.bam.bai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.subreads.bam.pbi
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.subreadset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim1.alignmentset.xml
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim1.pbalign.bam
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim1.pbalign.bam.bai
./usr/lib/python3/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim1.pbalign.bam.pbi
... and 82 more