معرفی شرکت ها


pycoqc_2.5.2+dfsg-1_all.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

computes metrics and generates Interactive QC plots
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main all
نام بسته pycoqc
نام فایل بسته pycoqc_2.5.2+dfsg-1_all.deb
نسخه بسته 2.5.2+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/a-slide/pycoQC
مجوز -
حجم دانلود 36212
حجم نصب 195
PycoQC computes metrics and generates interactive QC plots for Oxford Nanopore technologies sequencing data . PycoQC relies on the sequencing_summary.txt file generated by Albacore and Guppy, but if needed it can also generates a summary file from basecalled fast5 files. The package supports 1D and 1D2 runs generated with Minion, Gridion and Promethion devices and basecalled with Albacore 1.2.1+ or Guppy 2.1.3+


نیازمندی

مقدار نام
- python3-h5py-serial
- python3-jinja2
- python3-numpy
- python3-pandas
>= 4.1.0 python3-plotly
- python3-pysam
- python3-scipy
- python3-tqdm
- python3:any
- python3-h5py


نحوه نصب


نصب پکیج deb pycoqc:

    sudo apt-get install pycoqc_2.5.2+dfsg-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/Barcode_split
./usr/bin/Fast5_to_seq_summary
./usr/bin/pycoQC
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/Barcode_split.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/Fast5_to_seq_summary.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/__main__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/common.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/pycoQC.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/pycoQC_parse.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/pycoQC_plot.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/pycoQC_report.py
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/templates/pycoQC_config.json
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC/templates/spectre.html.j2
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC-2.5.2.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC-2.5.2.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC-2.5.2.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC-2.5.2.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/pycoQC-2.5.2.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/pycoqc/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/pycoqc/changelog.gz
./usr/share/doc/pycoqc/copyright
./usr/share/man/man1/Barcode_split.1.gz
./usr/share/man/man1/Fast5_to_seq_summary.1.gz
./usr/share/man/man1/pycoQC.1.gz