معرفی شرکت ها

presto_0.6.2-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

toolkit for processing B and T cell sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main all
نام بسته presto
نام فایل بسته presto_0.6.2-1_all.deb
نسخه بسته 0.6.2
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://presto.readthedocs.io
مجوز -
حجم دانلود 74216
حجم نصب 366
pRESTO is a toolkit for processing raw reads from high-throughput sequencing of B cell and T cell repertoires. . Dramatic improvements in high-throughput sequencing technologies now enable large-scale characterization of lymphocyte repertoires, defined as the collection of trans-membrane antigen-receptor proteins located on the surface of B cells and T cells. The REpertoire Sequencing TOolkit (pRESTO) is composed of a suite of utilities to handle all stages of sequence processing prior to germline segment assignment. pRESTO is designed to handle either single reads or paired-end reads. It includes features for quality control, primer masking, annotation of reads with sequence embedded barcodes, generation of unique molecular identifier (UMI) consensus sequences, assembly of paired-end reads and identification of duplicate sequences. Numerous options for sequence sorting, sampling and conversion operations are also included.


نیازمندی

مقدار نام
- python3:any
- python3-presto


نحوه نصب


نصب پکیج deb presto:

    sudo apt-get install presto_0.6.2-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/AlignSets.py
./usr/bin/AssemblePairs.py
./usr/bin/BuildConsensus.py
./usr/bin/ClusterSets.py
./usr/bin/CollapseSeq.py
./usr/bin/ConvertHeaders.py
./usr/bin/EstimateError.py
./usr/bin/FilterSeq.py
./usr/bin/MaskPrimers.py
./usr/bin/PairSeq.py
./usr/bin/ParseHeaders.py
./usr/bin/ParseLog.py
./usr/bin/SplitSeq.py
./usr/bin/UnifyHeaders.py
./usr/share/doc/presto/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/presto/changelog.gz
./usr/share/doc/presto/copyright
./usr/share/lintian/overrides/presto
./usr/share/man/man1/AlignSets.py.1.gz
./usr/share/man/man1/AssemblePairs.py.1.gz
./usr/share/man/man1/BuildConsensus.py.1.gz
./usr/share/man/man1/ClusterSets.py.1.gz
./usr/share/man/man1/CollapseSeq.py.1.gz
./usr/share/man/man1/ConvertHeaders.py.1.gz
./usr/share/man/man1/EstimateError.py.1.gz
./usr/share/man/man1/FilterSeq.py.1.gz
./usr/share/man/man1/MaskPrimers.py.1.gz
./usr/share/man/man1/PairSeq.py.1.gz
./usr/share/man/man1/ParseHeaders.py.1.gz
./usr/share/man/man1/ParseLog.py.1.gz
./usr/share/man/man1/SplitSeq.py.1.gz
./usr/share/man/man1/UnifyHeaders.py.1.gz