معرفی شرکت ها
python3-bcbio_1.2.5-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
library for analysing high-throughput sequencing data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bullseye-11 |
| مخزن | Debian contrib all |
| نام بسته | python3-bcbio |
| نام فایل بسته | python3-bcbio_1.2.5-1_all.deb |
| نسخه بسته | 1.2.5 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/bcbio/bcbio-nextgen |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1265100 |
| حجم نصب | 4851 |
This package installs the Python 3 libraries of the bcbio-nextgen
toolkit implementing best-practice pipelines for fully automated high
throughput sequencing analysis.
.
A high-level configuration file specifies inputs and analysis parameters
to drive a parallel pipeline that handles distributed execution,
idempotent processing restarts and safe transactional steps. The project
contributes a shared community resource that handles the data processing
component of sequencing analysis, providing researchers with more time
to focus on the downstream biology.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| python3-bcbio-gff_0.6.6-3_all.deb | 0.6.6 | all | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3:any |
| - | python3-biopython |
| - | python3-cyvcf2 |
| - | python3-joblib |
| - | python3-logbook |
| - | python3-matplotlib |
| - | python3-psutil |
| - | python3-pysam |
| - | python3-requests |
| - | python3-scipy |
| - | python3-six |
| - | python3-tornado |
نحوه نصب
نصب پکیج deb python3-bcbio:
sudo apt-get install python3-bcbio_1.2.5-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/callable.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/counts.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/coverage.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/cram.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/fasta.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/fastq.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/readstats.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/ref.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/skewer.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bam/trim.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/bed/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/broad/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/broad/metrics.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/broad/picardrun.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/chipseq/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/chipseq/antibodies.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/chipseq/atac.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/chipseq/macs2.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/chipseq/peaks.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/create.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/cwlutils.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/defs.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/hpc.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/inspect.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/main.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/tool.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/cwl/workflow.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/10x_v2-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/10x_v2-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/dropseq-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v2-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v2-cb2.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v2-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v3-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v3-cb2.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v3-sample_barcodes.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-indrop-v3-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-scrb-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/harvard-scrb-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/icell8-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/icell8-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/qiagen_smallRNA_umi-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/qiaseq-upx-384-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/qiaseq-upx-384-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/qiaseq-upx-96-cb1.txt.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/qiaseq-upx-96-transform.json |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/bcbio/data/umis/surecell-cb1.txt.gz |
| ... and 251 more |