معرفی شرکت ها
sift_4.0.3b-6+b1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian non-free amd64 |
| نام بسته | sift |
| نام فایل بسته | sift_4.0.3b-6+b1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 4.0.3b |
| انتشار بسته | 6+b1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://sift.bii.a-star.edu.sg/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 254064 |
| حجم نصب | 1031 |
SIFT is a sequence homology-based tool that sorts intolerant from tolerant
amino acid substitutions and predicts whether an amino acid substitution
in a protein will have a phenotypic effect. SIFT is based on the premise
that protein evolution is correlated with protein function. Positions
important for function should be conserved in an alignment of the protein
family, whereas unimportant positions should appear diverse in an alignment.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| siftool_2.8.3-1+b5_amd64.deb | 2.8.3 | amd64 | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_arm64.deb | 2.8.3 | arm64 | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_armel.deb | 2.8.3 | armel | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_armhf.deb | 2.8.3 | armhf | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_i386.deb | 2.8.3 | i386 | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_mips64el.deb | 2.8.3 | mips64el | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_mipsel.deb | 2.8.3 | mipsel | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_ppc64el.deb | 2.8.3 | ppc64el | Debian main |
| siftool_2.8.3-1+b5_s390x.deb | 2.8.3 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3.9+ds | libblimps3 |
| >= 2.29 | libc6 |
| - | blimps-utils |
| - | csh |
نحوه نصب
نصب پکیج deb sift:
sudo apt-get install sift_4.0.3b-6+b1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/sift/bin/Classify_SNPs_Indels.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/DNA_PROT_SUBROUTINES.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/IntersectLocations.sh |
| ./usr/lib/sift/bin/SIFT_exome_indels.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/SIFT_exome_nssnvs.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/SIFT_for_submitting_NCBI_gi_id.csh |
| ./usr/lib/sift/bin/SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh |
| ./usr/lib/sift/bin/SIFT_intersect_cds.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/SIFT_subroutines.pm |
| ./usr/lib/sift/bin/SNPClassifier/Classify_SNPs.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/SNPClassifier/Extract_Coding_Info.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/choose_seqs_via_psiblastseedmedian |
| ./usr/lib/sift/bin/clump_output_alignedseq |
| ./usr/lib/sift/bin/consensus_to_seq |
| ./usr/lib/sift/bin/detect_indel.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/detect_repeat.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/get_sequences.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/indelfile_to_gff.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/info_on_seqs |
| ./usr/lib/sift/bin/map_coords_to_bin.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/map_coords_to_bin_indels.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/model_transcript.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/perlscripts/get_BLINK_seq.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/perlscripts/separate_query_from_rest_of_seqs.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/psiblast_res_to_fasta_dbpairwise |
| ./usr/lib/sift/bin/reformat_chrfile.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/seqs_chosen_via_median_info.csh |
| ./usr/lib/sift/bin/seqs_from_psiblast_res |
| ./usr/lib/sift/bin/seqs_to_matrixweb |
| ./usr/lib/sift/bin/sift_feed_to_chr_coords_batch.pl |
| ./usr/lib/sift/bin/snv_db_engine.pl |
| ./usr/share/doc/sift/README.Debian |
| ./usr/share/doc/sift/README.gz |
| ./usr/share/doc/sift/README_4.0.3.gz |
| ./usr/share/doc/sift/VERSION_UPDATE |
| ./usr/share/doc/sift/changelog.Debian.amd64.gz |
| ./usr/share/doc/sift/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/sift/copyright |
| ./usr/share/doc/sift/examples/lacI.SIFTprediction |
| ./usr/share/doc/sift/examples/lacI.alignedfasta |
| ./usr/share/doc/sift/examples/lacI.fasta |
| ./usr/share/doc/sift/examples/lacI.fasta.query.out.gz |
| ./usr/share/doc/sift/examples/lacI.subst |
| ./usr/share/man/man1/SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/info_on_seqs.1.gz |
| ./usr/share/sift/IntersectFeatures.jar |
| ./usr/share/sift/blimps/docs/blosum62.bla.new |
| ./usr/share/sift/blimps/docs/coduse.csh |
| ./usr/share/sift/blimps/docs/config.doc |
| ./usr/share/sift/blimps/docs/default.amino.frq |
| ... and 24 more |