معرفی شرکت ها


sumatra_1.0.36+ds-2_armhf.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

fast and exact comparison and clustering of sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main armhf
نام بسته sumatra
نام فایل بسته sumatra_1.0.36+ds-2_armhf.deb
نسخه بسته 1.0.36+ds
انتشار بسته 2
معماری بسته armhf
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://metabarcoding.org/sumatra
مجوز -
حجم دانلود 79828
حجم نصب 175
With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumatra is a program developed by the LECA. Sumatra aims to compare sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumatra computes the pairwise alignment scores from one dataset or between two datasets, with the possibility to specify a similarity threshold under which pairs of sequences that have a lower similarity are not reported. The output can then go through a classification process with programs such as MCL or MOTHUR.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
sumatra_1.0.36+ds-2_amd64.deb 1.0.36+ds amd64 Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_arm64.deb 1.0.36+ds arm64 Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_armel.deb 1.0.36+ds armel Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_i386.deb 1.0.36+ds i386 Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_mips64el.deb 1.0.36+ds mips64el Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_mipsel.deb 1.0.36+ds mipsel Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_ppc64el.deb 1.0.36+ds ppc64el Debian main
sumatra_1.0.36+ds-2_s390x.deb 1.0.36+ds s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.7 libc6
>= 1.0.35 libsuma1


نحوه نصب


نصب پکیج deb sumatra:

    sudo apt-get install sumatra_1.0.36+ds-2_armhf.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/sumatra
./usr/share/doc/sumatra/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/sumatra/copyright
./usr/share/doc/sumatra/examples/README.test
./usr/share/doc/sumatra/examples/alignmentIdenticalInputs
./usr/share/doc/sumatra/examples/alignmentOneInput
./usr/share/doc/sumatra/examples/alignmentTwoInputsTwoThresholds
./usr/share/doc/sumatra/examples/run-unit-test
./usr/share/doc/sumatra/sumatra_user_manual.pdf
./usr/share/doc-base/sumatra.sumatra
./usr/share/man/man1/sumatra.1.gz