معرفی شرکت ها
r-bioc-monocle_2.26.0-2_armhf.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
clustering, differential expression, and trajectory analysis for RNA-Seq
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main armhf |
| نام بسته | r-bioc-monocle |
| نام فایل بسته | r-bioc-monocle_2.26.0-2_armhf.deb |
| نسخه بسته | 2.26.0 |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | armhf |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/monocle/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1417620 |
| حجم نصب | 1632 |
Monocle performs differential expression and time-series analysis
for single-cell expression experiments. It orders individual cells
according to progress through a biological process, without knowing ahead
of time which genes define progress through that process. Monocle also
performs differential expression analysis, clustering, visualization, and
other useful tasks on single cell expression data. It is designed to work
with RNA-Seq and qPCR data, but could be used with other types as well.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_amd64.deb | 2.26.0 | amd64 | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_arm64.deb | 2.26.0 | arm64 | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_armel.deb | 2.26.0 | armel | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_i386.deb | 2.26.0 | i386 | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_mips64el.deb | 2.26.0 | mips64el | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_mipsel.deb | 2.26.0 | mipsel | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_ppc64el.deb | 2.26.0 | ppc64el | Debian main |
| r-bioc-monocle_2.26.0-2_s390x.deb | 2.26.0 | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| >= 1.2-6 | r-cran-matrix |
| - | r-bioc-biobase |
| >= 1.0.0 | r-cran-ggplot2 |
| >= 1.0-6 | r-cran-vgam |
| >= 0.1.4 | r-cran-ddrtree |
| >= 1.0.1 | r-cran-igraph |
| - | r-bioc-biocgenerics |
| >= 0.101.5 | r-bioc-hsmmsinglecell |
| - | r-cran-plyr |
| - | r-cran-cluster |
| - | r-cran-combinat |
| - | r-cran-fastica |
| >= 2.0.0 | r-cran-irlba |
| - | r-cran-matrixstats |
| - | r-cran-rtsne |
| - | r-cran-mass |
| - | r-cran-reshape2 |
| >= 0.1.9 | r-cran-leidenbase |
| - | r-bioc-limma |
| - | r-cran-tibble |
| - | r-cran-dplyr |
| - | r-cran-qlcmatrix |
| - | r-cran-pheatmap |
| - | r-cran-stringr |
| - | r-cran-proxy |
| - | r-cran-slam |
| - | r-cran-viridis |
| - | r-bioc-biocviews |
| >= 2.5 | r-cran-rann |
| >= 0.12.0 | r-cran-rcpp |
| >= 2.4 | libc6 |
| >= 3.5 | libgcc-s1 |
| >= 11 | libstdc++6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-monocle:
sudo apt-get install r-bioc-monocle_2.26.0-2_armhf.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/data.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/R/monocle |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/R/monocle.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/R/monocle.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/data/Rdata.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/data/Rdata.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/data/Rdata.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/doc/monocle-vignette.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/doc/monocle-vignette.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/doc/monocle-vignette.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/extdata/lung_exprs_data.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/extdata/lung_feature_data.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/extdata/lung_phenotype_data.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/help/monocle.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/help/monocle.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/libs/monocle.so |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/basic_tests.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.addCellType.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.calculateMarkerSpecificity.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.classifyCells.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.clusterCells.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.detectGenes.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.differentialGeneTest.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.dispersionTable.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.estimateDispersions.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.markerDiffTable.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.newCellDataSet.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.newCellTypeHierarchy.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.orderCells.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.plotCellTrajectory.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.plot_cell_clusters.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.plot_genes_jitter.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.plot_ordering_genes.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.plot_pc_variance_explained.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.reduceDimension.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.relative2abs.R |
| ./usr/lib/R/site-library/monocle/tests/test.setOrderingFilter.R |
| ./usr/share/doc/r-bioc-monocle/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-monocle/copyright |