معرفی شرکت ها
r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_mipsel.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Gene Set Variation Analysis for microarray and RNA-seq data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Debian Bookworm-12 |
| مخزن | Debian main mipsel |
| نام بسته | r-bioc-gsva |
| نام فایل بسته | r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_mipsel.deb |
| نسخه بسته | 1.46.0+ds |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | mipsel |
| نگهدارنده | Debian R Packages Maintainers <r-pkg-team@alioth-lists.debian.net> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/GSVA/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 799996 |
| حجم نصب | 963 |
Gene Set Variation Analysis (GSVA) is a non-parametric, unsupervised
method for estimating variation of gene set enrichment through the
samples of a expression data set. GSVA performs a change in coordinate
systems, transforming the data from a gene by sample matrix to a gene-
set by sample matrix, thereby allowing the evaluation of pathway
enrichment for each sample. This new matrix of GSVA enrichment scores
facilitates applying standard analytical methods like functional
enrichment, survival analysis, clustering, CNV-pathway analysis or cross-
tissue pathway analysis, in a pathway-centric manner.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_amd64.deb | 1.46.0+ds | amd64 | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_arm64.deb | 1.46.0+ds | arm64 | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_armel.deb | 1.46.0+ds | armel | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_armhf.deb | 1.46.0+ds | armhf | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_i386.deb | 1.46.0+ds | i386 | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_mips64el.deb | 1.46.0+ds | mips64el | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_ppc64el.deb | 1.46.0+ds | ppc64el | Debian main |
| r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_s390x.deb | 1.46.0+ds | s390x | Debian main |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 4.2.2.20221110-1 | r-base-core |
| - | r-api-4.0 |
| - | r-api-bioc-3.16 |
| - | r-bioc-s4vectors |
| - | r-bioc-iranges |
| - | r-bioc-biobase |
| - | r-bioc-summarizedexperiment |
| - | r-bioc-gseabase |
| >= 1.5-0 | r-cran-matrix |
| - | r-bioc-biocparallel |
| - | r-bioc-singlecellexperiment |
| - | r-bioc-sparsematrixstats |
| - | r-bioc-delayedarray |
| - | r-bioc-delayedmatrixstats |
| - | r-bioc-hdf5array |
| - | r-bioc-biocsingular |
| >= 2.4 | libc6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-gsva:
sudo apt-get install r-bioc-gsva_1.46.0+ds-1_mipsel.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/R/GSVA |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/R/GSVA.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/R/GSVA.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/doc/GSVA.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/doc/GSVA.Rmd |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/extdata/cache4vignette_leukemia_es.RData |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/help/GSVA.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/help/GSVA.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/libs/GSVA.so |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/argumentsDataModule.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/closeModule.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/downloadModule.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/geneSetsModule.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/global.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/matrixModule.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/modalGSVAModule.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/plot1_Module.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/plot2_Module.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/plot3_Module.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/server.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/ui.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/www/GSVA.png |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/shinyApp/www/style.css |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/unitTests/test_delayed.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/unitTests/test_inputdatacontainers.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/unitTests/test_sparse.R |
| ./usr/lib/R/site-library/GSVA/unitTests/test_ssgsea.R |
| ./usr/share/doc/r-bioc-gsva/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/r-bioc-gsva/copyright |
| ./usr/share/doc/r-bioc-gsva/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/r-bioc-gsva/tests/runTests.R |