معرفی شرکت ها

clonalframeml_1.12-3_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Efficient Inference of Recombination in Whole Bacterial Genomes
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bookworm-12
مخزن Debian main amd64
نام بسته clonalframeml
نام فایل بسته clonalframeml_1.12-3_amd64.deb
نسخه بسته 1.12
انتشار بسته 3
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/xavierdidelot/ClonalFrameML
مجوز -
حجم دانلود 106320
حجم نصب 281
ClonalFrameML is a software package that performs efficient inference of recombination in bacterial genomes. ClonalFrameML was created by Xavier Didelot and Daniel Wilson. ClonalFrameML can be applied to any type of aligned sequence data, but is especially aimed at analysis of whole genome sequences. It is able to compare hundreds of whole genomes in a matter of hours on a standard Desktop computer. There are three main outputs from a run of ClonalFrameML: a phylogeny with branch lengths corrected to account for recombination, an estimation of the key parameters of the recombination process, and a genomic map of where recombination took place for each branch of the phylogeny. . ClonalFrameML is a maximum likelihood implementation of the Bayesian software ClonalFrame which was previously described by Didelot and Falush (2007). The recombination model underpinning ClonalFrameML is exactly the same as for ClonalFrame, but this new implementation is a lot faster, is able to deal with much larger genomic dataset, and does not suffer from MCMC convergence issues


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
clonalframeml_1.12-3_arm64.deb 1.12 arm64 Debian main
clonalframeml_1.12-3_armel.deb 1.12 armel Debian main
clonalframeml_1.12-3_armhf.deb 1.12 armhf Debian main
clonalframeml_1.12-3_i386.deb 1.12 i386 Debian main
clonalframeml_1.12-3_mips64el.deb 1.12 mips64el Debian main
clonalframeml_1.12-3_mipsel.deb 1.12 mipsel Debian main
clonalframeml_1.12-3_ppc64el.deb 1.12 ppc64el Debian main
clonalframeml_1.12-3_s390x.deb 1.12 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.34 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 11 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb clonalframeml:

    sudo apt-get install clonalframeml_1.12-3_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/ClonalFrameML
./usr/share/doc/clonalframeml/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/clonalframeml/copyright
./usr/share/man/man1/ClonalFrameML.1.gz